More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0250 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  80.74 
 
 
396 aa  660    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  80.74 
 
 
396 aa  660    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  100 
 
 
405 aa  823    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  100 
 
 
405 aa  823    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  76.54 
 
 
397 aa  628  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.54 
 
 
395 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  76.54 
 
 
397 aa  628  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  73.41 
 
 
405 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  73.41 
 
 
405 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  615  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  74.45 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.32 
 
 
400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  74.26 
 
 
400 aa  609  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  609  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  73.58 
 
 
397 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  73.58 
 
 
397 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  73.58 
 
 
399 aa  606  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  73.83 
 
 
400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  72.97 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  74.63 
 
 
397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.84 
 
 
400 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.33 
 
 
396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.33 
 
 
396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.33 
 
 
396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.33 
 
 
396 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.96 
 
 
400 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  73.33 
 
 
396 aa  594  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.85 
 
 
400 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  73.58 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.11 
 
 
399 aa  594  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  72.1 
 
 
396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  73.33 
 
 
396 aa  594  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.35 
 
 
396 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  71.6 
 
 
400 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.35 
 
 
397 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  73.71 
 
 
396 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  73.71 
 
 
396 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  72.2 
 
 
402 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  71.85 
 
 
396 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  71.85 
 
 
400 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  71.85 
 
 
400 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  74.07 
 
 
395 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.54 
 
 
399 aa  591  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  73.83 
 
 
396 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.35 
 
 
396 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.35 
 
 
396 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  73.58 
 
 
395 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  588  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.04 
 
 
399 aa  590  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  71.74 
 
 
397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  71.11 
 
 
400 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  71.36 
 
 
396 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.79 
 
 
399 aa  588  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  71.74 
 
 
397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  73.09 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  73.09 
 
 
396 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.99 
 
 
396 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  73.09 
 
 
396 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  71.74 
 
 
397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.99 
 
 
396 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  72.84 
 
 
396 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.1 
 
 
397 aa  587  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  71.74 
 
 
397 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>