More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0596 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0596  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  801    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00435785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  72.29 
 
 
395 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  72.29 
 
 
395 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.07 
 
 
399 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  69.21 
 
 
405 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.5 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  69.21 
 
 
405 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70.82 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.07 
 
 
399 aa  579  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  69.44 
 
 
395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  68.94 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  68.94 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  69.37 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  68.94 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  68.94 
 
 
394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  69.27 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  69.27 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.78 
 
 
396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  67.76 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  67.76 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  68.51 
 
 
396 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  69.6 
 
 
397 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  69.77 
 
 
396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  69.6 
 
 
397 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  69.52 
 
 
396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  69.52 
 
 
396 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  69.19 
 
 
394 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  69.19 
 
 
394 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  68.51 
 
 
396 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  68.51 
 
 
396 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  68.51 
 
 
396 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  70.2 
 
 
396 aa  564  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.02 
 
 
396 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  68.75 
 
 
399 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  68.69 
 
 
394 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  68.94 
 
 
394 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  69.08 
 
 
400 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  68.26 
 
 
396 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  68.26 
 
 
396 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  70.2 
 
 
396 aa  564  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  68.75 
 
 
399 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.02 
 
 
396 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  68.75 
 
 
399 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  67.93 
 
 
395 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  69.52 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  67.33 
 
 
400 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  68.1 
 
 
395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  69.02 
 
 
396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  69.02 
 
 
396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4007  translation elongation factor Tu  70.71 
 
 
397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206581  normal  0.828758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4022  translation elongation factor Tu  70.71 
 
 
397 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  69.52 
 
 
396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  67.76 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  67.92 
 
 
394 aa  561  1.0000000000000001e-159  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  67.76 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  68.01 
 
 
396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  68.26 
 
 
396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  67.34 
 
 
397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  67.76 
 
 
396 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  69.7 
 
 
396 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  69.19 
 
 
395 aa  559  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  68.77 
 
 
396 aa  558  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  69.7 
 
 
396 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  67.83 
 
 
400 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  68.09 
 
 
400 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  67.76 
 
 
396 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  70.2 
 
 
395 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  66.83 
 
 
400 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  69.02 
 
 
396 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  69.02 
 
 
396 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  72.18 
 
 
398 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  71.93 
 
 
398 aa  558  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  67.83 
 
 
400 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  68.09 
 
 
397 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  69.33 
 
 
399 aa  559  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  68.09 
 
 
397 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  68.09 
 
 
397 aa  557  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  68.77 
 
 
396 aa  558  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0319  elongation factor Tu  69.7 
 
 
394 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000444857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3738  elongation factor Tu  69.7 
 
 
394 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00744191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0401  elongation factor Tu  69.7 
 
 
394 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000273455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  70.03 
 
 
396 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3892  elongation factor Tu  69.7 
 
 
394 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00189739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  67.51 
 
 
397 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  66.33 
 
 
391 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  68.59 
 
 
397 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  66.33 
 
 
391 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  68.09 
 
 
397 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  68.09 
 
 
397 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  66.33 
 
 
391 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  68.77 
 
 
396 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  68.77 
 
 
396 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  66.33 
 
 
391 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  66.41 
 
 
397 aa  556  1e-157  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  67.73 
 
 
405 aa  557  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3867  elongation factor Tu  69.37 
 
 
394 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.62451e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>