More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2861 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 		 411 aa  834    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  71.05 
 
 		 411 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  76.12 
 
 		 403 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  71.29 
 
 		 411 aa  595  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  72.51 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.75 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.55 
 
 		 426 aa  490  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.86 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.05 
 
 		 408 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.86 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.36 
 
 		 410 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.61 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  57.78 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  55.5 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  55.8 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  56.05 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  56.08 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.04 
 
 		 412 aa  448  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.28 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.87 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.86 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  51.49 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.61 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  42.58 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  41.01 
 
 		 514 aa  341  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  41.01 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  41.87 
 
 		 473 aa  330  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.55 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.79 
 
 		 411 aa  328  9e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  41.23 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.68 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.67 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.83 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.07 
 
 		 634 aa  140  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.03 
 
 		 629 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.31 
 
 		 619 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.92 
 
 		 635 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  38.78 
 
 		 635 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.84 
 
 		 644 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  34.93 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  34.93 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  31.78 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.44 
 
 		 627 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.1 
 
 		 631 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  31.71 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  31.71 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  32.93 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.03 
 
 		 635 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  32.93 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  32.53 
 
 		 396 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  32.53 
 
 		 396 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  32.93 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  32.93 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  32.53 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.59 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.92 
 
 		 636 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  32.32 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  32.32 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  32.02 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.92 
 
 		 636 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  32.32 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  32.32 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.18 
 
 		 644 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  33.44 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  33.44 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  32.02 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  32 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  33.98 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  33.23 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  33.23 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.43 
 
 		 612 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  32 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  33.98 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  32.61 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.1 
 
 		 634 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.51 
 
 		 636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.99 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  32.23 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  32 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  30.84 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  32 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.81 
 
 		 650 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  31.61 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  32 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  31.79 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  33.09 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  33.09 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  30.95 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  30.95 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  32.02 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  31.93 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>