More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0605 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  79.16 
 
 
403 aa  639    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  77.13 
 
 
411 aa  663    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
411 aa  836    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  72.51 
 
 
411 aa  616  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  72.51 
 
 
411 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.51 
 
 
409 aa  522  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.79 
 
 
426 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.45 
 
 
410 aa  511  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.7 
 
 
410 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.45 
 
 
410 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.03 
 
 
408 aa  511  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.7 
 
 
410 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.17 
 
 
408 aa  486  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.74 
 
 
412 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.52 
 
 
410 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.86 
 
 
410 aa  476  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.54 
 
 
411 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  57.78 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  52.96 
 
 
415 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.42 
 
 
410 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.86 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.37 
 
 
423 aa  436  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.25 
 
 
415 aa  425  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  45.41 
 
 
514 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  44.34 
 
 
522 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  44.26 
 
 
463 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  43.35 
 
 
453 aa  346  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.12 
 
 
411 aa  344  2e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  42.34 
 
 
473 aa  340  4e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.56 
 
 
411 aa  339  5e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.56 
 
 
408 aa  339  7e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.79 
 
 
408 aa  338  9e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.83 
 
 
411 aa  336  5e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.81 
 
 
644 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.59 
 
 
634 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.7 
 
 
619 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.88 
 
 
635 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.73 
 
 
635 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.71 
 
 
627 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.35 
 
 
635 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.64 
 
 
629 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.25 
 
 
642 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.71 
 
 
627 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.01 
 
 
636 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.52 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.43 
 
 
628 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.68 
 
 
644 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  28.35 
 
 
641 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  28.19 
 
 
405 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  28.19 
 
 
405 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.22 
 
 
631 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.11 
 
 
643 aa  126  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.46 
 
 
636 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.74 
 
 
637 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.86 
 
 
650 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.71 
 
 
642 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.15 
 
 
636 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.79 
 
 
634 aa  123  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  28.61 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.79 
 
 
649 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  27.25 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  27.25 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.21 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  28.05 
 
 
395 aa  121  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.79 
 
 
649 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  28.34 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.15 
 
 
636 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.25 
 
 
612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.86 
 
 
649 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.73 
 
 
634 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.74 
 
 
636 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.06 
 
 
648 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.92 
 
 
570 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  27.79 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.06 
 
 
636 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.33 
 
 
565 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.33 
 
 
565 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  27.79 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.85 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  26.27 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.06 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.29 
 
 
601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  28.38 
 
 
400 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  28.73 
 
 
395 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  30.65 
 
 
396 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  27.15 
 
 
395 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  27.15 
 
 
395 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  30.65 
 
 
396 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.57 
 
 
634 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  28.38 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  27.13 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.97 
 
 
649 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  28.44 
 
 
395 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09660  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.24 
 
 
594 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.83 
 
 
643 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.7 
 
 
643 aa  116  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  27.38 
 
 
397 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  29.05 
 
 
396 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  27.38 
 
 
397 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  26.5 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>