More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32338 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  72.81 
 
 		 514 aa  680    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  100 
 
 		 463 aa  946    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  70.72 
 
 		 522 aa  667    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  66.81 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  64.06 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.23 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.99 
 
 		 410 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.39 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.9 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.28 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.52 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  45.77 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  47.38 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.63 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.6 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.26 
 
 		 411 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.88 
 
 		 411 aa  352  7e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.58 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.68 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.6 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  42.45 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.59 
 
 		 420 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.08 
 
 		 415 aa  337  3.9999999999999995e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.65 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  40.76 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  41.18 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.71 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.84 
 
 		 410 aa  309  8e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.28 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.57 
 
 		 411 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  38.11 
 
 		 408 aa  302  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.91 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  38.72 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.68 
 
 		 644 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.52 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.12 
 
 		 634 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.72 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.99 
 
 		 635 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.43 
 
 		 635 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.29 
 
 		 642 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.63 
 
 		 644 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.82 
 
 		 650 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.02 
 
 		 636 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.85 
 
 		 657 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.63 
 
 		 636 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.46 
 
 		 636 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.63 
 
 		 636 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.28 
 
 		 627 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.14 
 
 		 635 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  28.31 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  28.31 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.52 
 
 		 642 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.05 
 
 		 634 aa  97.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.24 
 
 		 636 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.07 
 
 		 629 aa  97.1  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2054  elongation factor Tu  29.68 
 
 		 395 aa  96.7  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00228831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  30.97 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.63 
 
 		 636 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.63 
 
 		 636 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.79 
 
 		 631 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0487  elongation factor Tu  29.18 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0783244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  29.66 
 
 		 627 aa  95.9  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0929  elongation factor Tu  27.3 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000367222  hitchhiker  0.00313256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0931  elongation factor Tu  27.3 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000100695  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  25.29 
 
 		 628 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  28.24 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.16 
 
 		 643 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  25.75 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.34 
 
 		 601 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.67 
 
 		 637 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  25.61 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  28.62 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  28.62 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  25.61 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  29.82 
 
 		 396 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  29.82 
 
 		 396 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  29.96 
 
 		 396 aa  94  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4917  elongation factor Tu  28.78 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0581  elongation factor Tu  28.78 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.67 
 
 		 641 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.67 
 
 		 637 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  28.62 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  29 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0611  elongation factor Tu  29.79 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000377135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0624  elongation factor Tu  29.79 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.137052  hitchhiker  2.36831e-16 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  28.62 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  28.57 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  26.01 
 
 		 400 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  29.39 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  26.95 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  26.95 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  27.74 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.16 
 
 		 643 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  28.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  28.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  28.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.62 
 
 		 637 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  28.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  28.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  28.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>