More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2240 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  77.13 
 
 
411 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
411 aa  833    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  77.17 
 
 
403 aa  629  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  73.24 
 
 
411 aa  625  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  71.05 
 
 
411 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  62.72 
 
 
409 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.55 
 
 
426 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.45 
 
 
410 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.45 
 
 
410 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.2 
 
 
410 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.7 
 
 
410 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  61.04 
 
 
408 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  59.01 
 
 
410 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  59.01 
 
 
409 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.36 
 
 
410 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.77 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  56.58 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  57.28 
 
 
411 aa  464  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.52 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  52.46 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.25 
 
 
420 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.86 
 
 
423 aa  430  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  49.14 
 
 
415 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  44.93 
 
 
522 aa  358  9e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  44.6 
 
 
463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  44.02 
 
 
514 aa  352  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.04 
 
 
411 aa  351  1e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.05 
 
 
411 aa  348  9e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.26 
 
 
411 aa  347  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.5 
 
 
408 aa  346  4e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.3 
 
 
408 aa  345  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  44.6 
 
 
473 aa  338  9e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  43.07 
 
 
453 aa  329  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.98 
 
 
634 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.1 
 
 
644 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.06 
 
 
619 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.81 
 
 
631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.6 
 
 
635 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.67 
 
 
628 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.59 
 
 
627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.1 
 
 
629 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.88 
 
 
635 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.83 
 
 
635 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.18 
 
 
627 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.89 
 
 
644 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.44 
 
 
642 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.59 
 
 
642 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.71 
 
 
636 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.32 
 
 
636 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.75 
 
 
636 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01084  hypothetical protein similar to elongation factor EF-Tu (Broad)  30.06 
 
 
439 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0447  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.17 
 
 
649 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436923  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  33.85 
 
 
397 aa  124  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  32.93 
 
 
396 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2019  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.76 
 
 
634 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0284313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  32.93 
 
 
396 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0448  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.9 
 
 
649 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4150  selenocysteine-specific translation elongation factor  30.6 
 
 
649 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  29.86 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  29.86 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  27.11 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  27.4 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.23 
 
 
634 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  27.4 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  33 
 
 
650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.37 
 
 
637 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  27.85 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  27.85 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  27.11 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  27.4 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  27.4 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.89 
 
 
643 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.23 
 
 
636 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.63 
 
 
646 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  28.15 
 
 
637 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.75 
 
 
635 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.51 
 
 
636 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  31.48 
 
 
394 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  31.48 
 
 
394 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  31.87 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  32.23 
 
 
430 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.52 
 
 
635 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.83 
 
 
637 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  31.49 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  31.49 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.07 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0419  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  31.64 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  31.49 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  29.67 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  28.24 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  28.24 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  32.68 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.57 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  33.98 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  31.48 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
636 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  28.38 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  27.19 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  31.48 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  31.48 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>