More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04524 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  92.97 
 
 		 396 aa  724    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  81.04 
 
 		 397 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  80.42 
 
 		 396 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  85.68 
 
 		 396 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  85.68 
 
 		 396 aa  673    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  82.81 
 
 		 396 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  82.81 
 
 		 396 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  100 
 
 		 384 aa  776    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3445  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00653639  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  83.81 
 
 		 396 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  83.81 
 
 		 396 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  81.28 
 
 		 402 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0624  translation elongation factor Tu  80.68 
 
 		 397 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000430921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  83.33 
 
 		 396 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  92.97 
 
 		 396 aa  724    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4550  elongation factor Tu  80.99 
 
 		 397 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0141185  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0305  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.58276e-16  normal  0.0546751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0317  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.28692e-16  hitchhiker  0.000217605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  82.77 
 
 		 396 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  82.77 
 
 		 396 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0391  elongation factor Tu  82.2 
 
 		 396 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.578399  decreased coverage  0.00326089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  82.2 
 
 		 396 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000926456  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  79.63 
 
 		 396 aa  634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  80.99 
 
 		 396 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  80.99 
 
 		 396 aa  654    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2101  elongation factor Tu  88.25 
 
 		 396 aa  689    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.235673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  82.81 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2114  elongation factor Tu  88.25 
 
 		 396 aa  689    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  81.04 
 
 		 400 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  81.3 
 
 		 397 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  81.3 
 
 		 397 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  80.21 
 
 		 396 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  80.21 
 
 		 396 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2191  elongation factor Tu  88.51 
 
 		 396 aa  691    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2203  elongation factor Tu  88.51 
 
 		 396 aa  691    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000805833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  81.72 
 
 		 396 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  82.25 
 
 		 396 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  81.98 
 
 		 396 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  658    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  86.46 
 
 		 396 aa  680    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  82.25 
 
 		 396 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  81.51 
 
 		 396 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  83.29 
 
 		 396 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  83.29 
 
 		 396 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3458  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0650384  normal  0.118326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  80.16 
 
 		 396 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000026192  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  81.46 
 
 		 396 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  82.77 
 
 		 396 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  82.77 
 
 		 396 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  81.46 
 
 		 396 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3904  elongation factor Tu  84.07 
 
 		 396 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.806817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0276  elongation factor Tu  84.33 
 
 		 396 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000219388  decreased coverage  0.00000000221899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  82.81 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  79.74 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  79.74 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  82.03 
 
 		 396 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  79.74 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  79.74 
 
 		 397 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  82.25 
 
 		 396 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  81.04 
 
 		 397 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  81.04 
 
 		 397 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  82.55 
 
 		 396 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  100 
 
 		 384 aa  776    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  81.77 
 
 		 396 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  82.29 
 
 		 396 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>