More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0247 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  79.16 
 
 
411 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  100 
 
 
403 aa  818    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  77.17 
 
 
411 aa  653    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  76.12 
 
 
411 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  71.22 
 
 
411 aa  598  1e-170  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.2 
 
 
409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.35 
 
 
410 aa  508  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  60.35 
 
 
426 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.85 
 
 
410 aa  498  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.35 
 
 
410 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.35 
 
 
410 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.85 
 
 
410 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  60.3 
 
 
410 aa  491  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.8 
 
 
408 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  60.3 
 
 
409 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  59.65 
 
 
412 aa  475  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  58.1 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  56.82 
 
 
411 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  53.22 
 
 
415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  58.56 
 
 
410 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  52.37 
 
 
420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  50.86 
 
 
423 aa  435  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  51.12 
 
 
415 aa  423  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  44.55 
 
 
514 aa  361  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  44.6 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  43.48 
 
 
522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  46.02 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.31 
 
 
411 aa  341  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  44.12 
 
 
473 aa  339  4e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  42.51 
 
 
453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.69 
 
 
411 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.8 
 
 
408 aa  338  9e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.32 
 
 
411 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  28.83 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  28.83 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  38.19 
 
 
634 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.55 
 
 
635 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.08 
 
 
627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.33 
 
 
644 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  29.68 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  29.68 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  28.54 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.9 
 
 
619 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.21 
 
 
628 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  30.68 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  30.68 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  27.55 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  28.25 
 
 
405 aa  127  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  28.54 
 
 
405 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  28.25 
 
 
405 aa  127  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  28.54 
 
 
405 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.33 
 
 
644 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.5 
 
 
635 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.57 
 
 
635 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.86 
 
 
642 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  28.44 
 
 
397 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  29.63 
 
 
397 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.16 
 
 
636 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  28.31 
 
 
396 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  28.5 
 
 
396 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.47 
 
 
397 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  28.6 
 
 
396 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  28.31 
 
 
396 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  28.31 
 
 
396 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  29.51 
 
 
396 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  29.51 
 
 
396 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  29.74 
 
 
396 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  29.74 
 
 
396 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  28.27 
 
 
396 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  26.82 
 
 
399 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.68 
 
 
629 aa  122  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  28.9 
 
 
395 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  28.24 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.77 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4550  elongation factor Tu  30.37 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0141185  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  27.98 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  27.98 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  27.65 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  29.7 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  27.97 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  31.6 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.27 
 
 
627 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.77 
 
 
637 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  29.55 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  29.55 
 
 
396 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  35.29 
 
 
650 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  27.78 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.05 
 
 
601 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  28.92 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1982  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  34.81 
 
 
612 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.869997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  28.15 
 
 
396 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  28.15 
 
 
396 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  28.48 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  29.79 
 
 
400 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  29.22 
 
 
394 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  29.22 
 
 
394 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  36.95 
 
 
636 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  27.89 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  27.89 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  27.89 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>