More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0792 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  100 
 
 		 399 aa  812    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  80.5 
 
 		 400 aa  672    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  80.25 
 
 		 400 aa  658    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  80.25 
 
 		 400 aa  658    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  77.69 
 
 		 397 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  77.69 
 
 		 397 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  81.75 
 
 		 400 aa  682    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 396 aa  622  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 400 aa  620  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 400 aa  620  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.69 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.43 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  73.18 
 
 		 397 aa  607  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  73.58 
 
 		 405 aa  606  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  73.58 
 
 		 405 aa  606  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.43 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  73.4 
 
 		 405 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  73.4 
 
 		 405 aa  605  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 400 aa  597  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  72.59 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  72.59 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 397 aa  594  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4028  elongation factor Tu  74.63 
 
 		 401 aa  584  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  hitchhiker  0.00000974612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  70 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1541  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.161942  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1553  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000482346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 399 aa  584  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  67.65 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  69.73 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  73.38 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  69.17 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1187  elongation factor Tu  74.13 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  70.78 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  69.33 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  69.08 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  71.01 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  69.77 
 
 		 396 aa  581  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.18 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  69.25 
 
 		 399 aa  578  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  69.67 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  69.92 
 
 		 397 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  71.01 
 
 		 405 aa  578  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4913  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00837266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  67.92 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  67.92 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  68.33 
 
 		 400 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0118  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0332354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>