More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2618 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2618  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
685 aa  1294    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2380  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
670 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000186709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.39 
 
 
389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.56 
 
 
391 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  40.93 
 
 
516 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
378 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 
516 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.02 
 
 
941 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3900  serine phosphatase  30.95 
 
 
642 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3974  stage II sporulation E family protein  30.95 
 
 
661 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135452  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3915  stage II sporulation E family protein  31.32 
 
 
661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  46.74 
 
 
391 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  43.32 
 
 
413 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  43.32 
 
 
413 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  43.32 
 
 
413 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
371 aa  139  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.82 
 
 
572 aa  127  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2748  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.75 
 
 
399 aa  124  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  36.25 
 
 
455 aa  124  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.8 
 
 
563 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.92 
 
 
687 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  34.44 
 
 
1087 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  35.84 
 
 
708 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  38.66 
 
 
393 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.02 
 
 
1087 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  40.7 
 
 
340 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2356  PAS sensor protein  30.21 
 
 
668 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.51 
 
 
423 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2883  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.72 
 
 
849 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483333  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  34.54 
 
 
381 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  29.63 
 
 
462 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
413 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.07 
 
 
467 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.44 
 
 
497 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  31.84 
 
 
1083 aa  108  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  30.54 
 
 
1082 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.59 
 
 
1004 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 
410 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  29.15 
 
 
463 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.79 
 
 
366 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  26.55 
 
 
474 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.75 
 
 
995 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  31.85 
 
 
470 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  27.07 
 
 
477 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.47 
 
 
997 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.39 
 
 
1332 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  27.64 
 
 
636 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  26.37 
 
 
474 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  26.37 
 
 
474 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  31.48 
 
 
706 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  28.62 
 
 
460 aa  100  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  31.47 
 
 
429 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.96 
 
 
1017 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.37 
 
 
469 aa  99.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.61 
 
 
507 aa  99  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 
637 aa  98.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.62 
 
 
590 aa  98.2  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  31.69 
 
 
1079 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  35.26 
 
 
631 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  29.83 
 
 
1100 aa  97.8  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  32.02 
 
 
570 aa  97.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.68 
 
 
465 aa  97.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  33.51 
 
 
637 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  27.68 
 
 
465 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.87 
 
 
649 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.07 
 
 
385 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  27.78 
 
 
464 aa  96.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.56 
 
 
563 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.2 
 
 
396 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.74 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0392  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.24 
 
 
888 aa  95.5  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.301142  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.59 
 
 
447 aa  94.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  40.72 
 
 
453 aa  94.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 
536 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  34.54 
 
 
438 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  30.59 
 
 
853 aa  92.8  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  23.15 
 
 
447 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.52 
 
 
1480 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30 
 
 
467 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 
716 aa  92.8  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  30.24 
 
 
885 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  29.25 
 
 
459 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.41 
 
 
447 aa  90.9  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.51 
 
 
684 aa  90.5  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.41 
 
 
957 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.54 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 
775 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.8 
 
 
612 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.25 
 
 
486 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 
961 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
479 aa  87.8  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  33.88 
 
 
451 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.02 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  32.8 
 
 
683 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  31 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  32.26 
 
 
630 aa  85.5  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  33.06 
 
 
723 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.23 
 
 
792 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  36.79 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>