235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4114 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
426 aa  846    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  46.4 
 
 
393 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  30.81 
 
 
406 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 
415 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  30.77 
 
 
425 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  36.4 
 
 
414 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  32.33 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 
412 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  27.71 
 
 
431 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  27.38 
 
 
389 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  24.18 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  28.88 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  30.85 
 
 
428 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.3 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  26.64 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.9 
 
 
486 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.21 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.88 
 
 
606 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25 
 
 
644 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  24.29 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  21.3 
 
 
705 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  26.32 
 
 
642 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  30.26 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  23.69 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  28.11 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.84 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  23.26 
 
 
464 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.42 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  27.66 
 
 
708 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  26 
 
 
648 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  25.09 
 
 
642 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.44 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  25.97 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
705 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  27 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  25.11 
 
 
708 aa  67  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.81 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  27.78 
 
 
630 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  26.05 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  26.21 
 
 
660 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  29.26 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.78 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.79 
 
 
678 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  25.84 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.41 
 
 
470 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  24.27 
 
 
451 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  26.84 
 
 
1087 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.85 
 
 
754 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.6 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  24.03 
 
 
716 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  26.6 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  23.14 
 
 
254 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.73 
 
 
941 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  23.05 
 
 
560 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  24.39 
 
 
683 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  23.69 
 
 
687 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27 
 
 
572 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.73 
 
 
470 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  24.32 
 
 
462 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  29.61 
 
 
371 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.5 
 
 
389 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  26.84 
 
 
1087 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  24.29 
 
 
631 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  27.85 
 
 
671 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.36 
 
 
684 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  22.76 
 
 
543 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  25.4 
 
 
1100 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  28.08 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  27.24 
 
 
584 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.75 
 
 
549 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0195  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  26.28 
 
 
821 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  25.2 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.35 
 
 
961 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  27.06 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  24.16 
 
 
543 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  26.86 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.09 
 
 
563 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  27.93 
 
 
560 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.02 
 
 
957 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  24.88 
 
 
453 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25.3 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 
516 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  23.05 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  24.89 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  23.08 
 
 
443 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  21.2 
 
 
497 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  20.88 
 
 
454 aa  56.6  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  23.55 
 
 
397 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.22 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.76 
 
 
486 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  21.93 
 
 
650 aa  55.1  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  20.44 
 
 
590 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  26.97 
 
 
365 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  31.87 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  25.46 
 
 
570 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  26.63 
 
 
535 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>