More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2194 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 423 aa  835    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  43.5 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  46.05 
 
 		 492 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  41.28 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  44.17 
 
 		 428 aa  272  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  38.63 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  39.79 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  39.7 
 
 		 425 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  40.16 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  37.47 
 
 		 412 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  38.16 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  38.85 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  37.6 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.51 
 
 		 684 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  30.5 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.08 
 
 		 631 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  32.21 
 
 		 683 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  28.45 
 
 		 705 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  29.96 
 
 		 705 aa  86.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  28.93 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  29.39 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  24.65 
 
 		 612 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  31.18 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.1 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  25.56 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  29.77 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  29.89 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.62 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  26.19 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.23 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  29.58 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  26.87 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  29.95 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.53 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  33.83 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 		 563 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.77 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  29.37 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  27.36 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  31.13 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  25.91 
 
 		 1079 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.6 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  29.1 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 		 642 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  25.42 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.52 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.77 
 
 		 526 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  31.53 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  28.8 
 
 		 1087 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  32.68 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.13 
 
 		 1083 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  27.95 
 
 		 1082 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  28.31 
 
 		 853 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.22 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 637 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  28.57 
 
 		 687 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  25.96 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.14 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.39 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  24.29 
 
 		 678 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.39 
 
 		 1017 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.95 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.51 
 
 		 1087 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  29.09 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  27.82 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.57 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  30.3 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.47 
 
 		 961 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  27.16 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  26.01 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.73 
 
 		 708 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  28.23 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  29.54 
 
 		 260 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  30.32 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.31 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  28.29 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.42 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  35.45 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  25.61 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3698  Stage II sporulation E family protein  36.73 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0288597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  25.52 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  26.38 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.21 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  28.51 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  31.9 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.7 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  29.95 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  27.51 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 967 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 967 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  26.32 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>