More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5480 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 455 aa  878    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  62.83 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  47.43 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  39.69 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  40.51 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  47.92 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  40.4 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  44.76 
 
 		 375 aa  176  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  43.5 
 
 		 346 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  45.77 
 
 		 315 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  40.76 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  42.31 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 		 369 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  39.37 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.95 
 
 		 359 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  36.22 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  29.46 
 
 		 391 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  34.65 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  33.17 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  31.52 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 		 956 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.81 
 
 		 1051 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  33.83 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 		 1432 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.54 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  31.49 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 		 693 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  29.64 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.85 
 
 		 1100 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  37.24 
 
 		 770 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.85 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.7 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  32.93 
 
 		 797 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.77 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.35 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.96 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  34.13 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.52 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.8 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.62 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1552  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  28.88 
 
 		 618 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 		 544 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  32.11 
 
 		 700 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.31 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  27.31 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  29.68 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  32.12 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  30.33 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  32.44 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.67 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.02 
 
 		 775 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.12 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.32 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5165  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.4 
 
 		 583 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115407  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  31 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  31 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  32.48 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  31.22 
 
 		 438 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  32.24 
 
 		 652 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  30.36 
 
 		 851 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.53 
 
 		 1087 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 		 547 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 1385 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 685 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.71 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.99 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 		 865 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.17 
 
 		 828 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  24.83 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 		 932 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.88 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.65 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.55 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  29.63 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  28.85 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.27 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.56 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33 
 
 		 847 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  30.94 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.91 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  30.56 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1248 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  29.32 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.89 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.5 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 1361 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.44 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  32.48 
 
 		 708 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  29.53 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  28.06 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  29.5 
 
 		 846 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>