More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0088 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 375 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  88.53 
 
 		 375 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  57.54 
 
 		 372 aa  335  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  40.64 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  43.62 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  38.12 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  42.9 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  41.19 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.48 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.3 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  40.53 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  37.19 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  41.78 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  36.6 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  44.8 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  44.03 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  31.67 
 
 		 397 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  38.79 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  35.96 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.95 
 
 		 581 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.33 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.1 
 
 		 738 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  35.41 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.69 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.47 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.87 
 
 		 693 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.39 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  32.65 
 
 		 658 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  29.84 
 
 		 533 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  24.92 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.93 
 
 		 748 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  26.09 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.8 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  27.88 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.09 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.47 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  30.51 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  30.51 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25.45 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  34.2 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.89 
 
 		 1332 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 		 697 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  30.32 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  34.46 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  32.45 
 
 		 249 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  35.95 
 
 		 412 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  29.58 
 
 		 692 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  33.61 
 
 		 525 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.45 
 
 		 697 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.51 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  30.9 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.58 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  34.52 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.1 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  29.27 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.57 
 
 		 590 aa  69.7  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.05 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  30.92 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  32.8 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.27 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  32.03 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  32.32 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  25.62 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.64 
 
 		 847 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  26.37 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  35.45 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  35.57 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  30.34 
 
 		 693 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  36.19 
 
 		 685 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.02 
 
 		 655 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.37 
 
 		 1051 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  38.51 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  27.8 
 
 		 800 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  33.46 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  29.56 
 
 		 716 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.85 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  28.52 
 
 		 1087 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 1361 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  29.34 
 
 		 781 aa  65.1  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.53 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.3 
 
 		 961 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.45 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  29.25 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  28.1 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 1385 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.03 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.28 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  31.25 
 
 		 708 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  34.62 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  34.2 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>