More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2794 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  100 
 
 
376 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  61.67 
 
 
369 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  45.38 
 
 
400 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.62 
 
 
359 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  45.42 
 
 
315 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  39.42 
 
 
346 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 
400 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  39.11 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  38.26 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  37.25 
 
 
375 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  36.68 
 
 
391 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  36.9 
 
 
395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  37.13 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
455 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  36.66 
 
 
363 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  33.33 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 
372 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  37.75 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  33.43 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 
581 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.49 
 
 
1087 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  32.17 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  32.17 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.03 
 
 
694 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.27 
 
 
693 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  32.56 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25.28 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.78 
 
 
1480 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  28.77 
 
 
743 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  29.78 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.57 
 
 
1087 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  29.72 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  24.91 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  32.34 
 
 
585 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.27 
 
 
549 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 
781 aa  76.3  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 
652 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 
574 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 
607 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.72 
 
 
728 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  29.67 
 
 
633 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.43 
 
 
961 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 
512 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.4 
 
 
1051 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  25 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  30.58 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 
721 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.8 
 
 
579 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  30.9 
 
 
544 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  29.33 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  30.32 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  32.84 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  28.1 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.25 
 
 
738 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  31.32 
 
 
776 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  29.53 
 
 
546 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.77 
 
 
775 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  28.42 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.66 
 
 
705 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0145  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  27.06 
 
 
786 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.47 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4996  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 
572 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 
693 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  27.06 
 
 
785 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  29.04 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.46 
 
 
748 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  29.25 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.78 
 
 
572 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.29 
 
 
957 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.62 
 
 
1045 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.32 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  26.11 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.32 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  29.81 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  23.79 
 
 
454 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  26.51 
 
 
670 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  32.08 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  26.51 
 
 
667 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  32.32 
 
 
956 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.7 
 
 
1332 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  29.63 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  30.84 
 
 
594 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3764  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 
643 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124369  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  29.03 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 
770 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  30.04 
 
 
566 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  31.92 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>