More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0085 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0085  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 375 aa  727    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  normal  0.0411446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0088  stage II sporulation E family protein  88.53 
 
 		 375 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5915  protein serine/threonine phosphatase  57.82 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  42.41 
 
 		 400 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2103  Stage II sporulation E family protein  41.84 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0249  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.54 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  40.77 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  36.72 
 
 		 363 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1695  stage II sporulation E family protein  42.12 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2794  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.8 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0174  serine phosphatase  40.73 
 
 		 390 aa  175  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.872629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1873  protein serine/threonine phosphatase  37.29 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.755002  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5452  protein serine/threonine phosphatase  38.71 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180738  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  44.18 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4609  protein serine/threonine phosphatase  35.39 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.919573  decreased coverage  0.0000074817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6901  protein serine/threonine phosphatase  43.8 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  35.43 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1132  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3955  protein serine/threonine phosphatase  32.83 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0050262  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  40.38 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 		 581 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.46 
 
 		 738 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.69 
 
 		 445 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  34.93 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.27 
 
 		 549 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  34.59 
 
 		 693 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  27.96 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  31.65 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  30.29 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  29.33 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  30.93 
 
 		 533 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2911  protein serine/threonine phosphatase  34.92 
 
 		 658 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5158  serine phosphatase  30.08 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5247  putative GAF sensor protein  30.08 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.18 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.72 
 
 		 705 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.95 
 
 		 748 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  26.32 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  34.41 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.96 
 
 		 1332 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.32 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5539  putative GAF sensor protein  30.08 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1031  putative GAF sensor protein  32.79 
 
 		 525 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 		 607 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.59 
 
 		 708 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  30.12 
 
 		 700 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  30.52 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  27.23 
 
 		 633 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  31.41 
 
 		 249 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.26 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  31.68 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.05 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1632  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1571  putative PAS/PAC sensor protein  30.86 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  30.12 
 
 		 576 aa  69.7  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2239  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.81 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.81 
 
 		 847 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.48 
 
 		 590 aa  69.7  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.89 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.52 
 
 		 697 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.04 
 
 		 1051 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  26.4 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  36.91 
 
 		 770 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  33.21 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  27.9 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.01 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.83 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  31.05 
 
 		 663 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.87 
 
 		 486 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.3 
 
 		 1087 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  31.61 
 
 		 846 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.34 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  37.84 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0659  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.36 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  30.12 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 		 716 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  25.25 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  34.68 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.19 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1385 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1361 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.8 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  29.02 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2083  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.02 
 
 		 672 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  29.18 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.64 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  29.44 
 
 		 781 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.38 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.53 
 
 		 957 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2597  putative PAS/PAC sensor protein  32.55 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  35.21 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>