228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0107 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  100 
 
 		 402 aa  810    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  99.25 
 
 		 402 aa  806    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  99 
 
 		 402 aa  801    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  65.42 
 
 		 399 aa  542  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  52.96 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0922  translocation protein TolB  54.27 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.484523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  52.72 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0520  TolB domain protein  47.99 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  47.63 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  45.26 
 
 		 417 aa  359  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.13 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.91 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.65 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  26.49 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  23.66 
 
 		 442 aa  93.6  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.61 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  24.01 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  25.48 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  22.9 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  25.1 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 442 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  25.1 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.36 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  25.1 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  25.1 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  24.8 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  27.99 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 438 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.24 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.53 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.35 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.35 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.93 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  22.79 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  23.64 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.14 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.78 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  22.71 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  29.33 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  24.56 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  25.27 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  23.64 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  27.59 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  20.99 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  26.87 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  21.76 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  27.31 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  25.33 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.33 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.31 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  27.63 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  23.72 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  24.29 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  24.14 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.29 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.67 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  23.04 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  24.7 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.69 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.69 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.72 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  26.87 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  25 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.87 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  22.58 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  23.9 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  22.12 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  21.24 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  22.12 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  22.47 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  22.12 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  24.19 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  24.3 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  24.78 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  23.72 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  24.05 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  24.78 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  22.9 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  22.31 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  22.31 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  25.38 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  23.02 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  25.68 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  23.58 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  23.9 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>