215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0200 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  100 
 
 		 399 aa  814    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  65.42 
 
 		 402 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  65.67 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  65.17 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0922  translocation protein TolB  53.68 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.484523  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  51.9 
 
 		 421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  50.36 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  49.88 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0520  TolB domain protein  46.68 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  41.53 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.79 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.14 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.76 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  23.15 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  24.1 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  27 
 
 		 432 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.73 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  23.19 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  23.75 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  24.42 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  22.49 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.12 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  25.95 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  22.49 
 
 		 442 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  22.49 
 
 		 442 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  23.6 
 
 		 442 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  23.6 
 
 		 442 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  24.43 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  24.78 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  21.57 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  22.57 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  22.09 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  23.15 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  22.14 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  22.09 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  22.09 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  22.49 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  24.48 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  24.48 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  21.29 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.2 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  22.56 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  23.19 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  23.72 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  23.65 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.89 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  21.65 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.09 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  23.01 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  22.32 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  22.82 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  21.29 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.38 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  23.53 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  22.59 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  23.51 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  19.74 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  22.71 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  25.25 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  20.75 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  21.91 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  26.53 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  22.02 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.24 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  22.13 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  22.57 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  22.09 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  22.53 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.12 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  22.53 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  23 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  23 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  23.11 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  23.62 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  19.3 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  23.41 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  22.43 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  22.39 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.5 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  22.43 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  21.65 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  21.65 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  23.27 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  19.75 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  24 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  23.84 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  23.01 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  23.01 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  21.65 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  23 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  19.75 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  22.79 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  25.35 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  22.61 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  22.54 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>