216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0520 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0520  TolB domain protein  100 
 
 		 422 aa  869    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  51.77 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0922  translocation protein TolB  52.01 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.484523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  52.49 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  50.24 
 
 		 417 aa  431  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  46.68 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  47.99 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  47.99 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  48.35 
 
 		 402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  45.37 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.68 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.74 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  23.95 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.54 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  22.4 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  24.31 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.31 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  23.26 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  26.45 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  25.57 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  24.01 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  21.84 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.2 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  22.61 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.57 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  23.91 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.4 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  23.63 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  23.71 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  24.7 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  22.91 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  20.45 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  27.62 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  25.52 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.21 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  23.24 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  20.55 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  20.6 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  22.99 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  23.01 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  20.16 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  22.99 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  26.21 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  25.73 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  24.57 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.32 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  20.79 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  22.57 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  20.79 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.9 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  21.55 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.95 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.9 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  23.93 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  20.68 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  23.77 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.71 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.9 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  20.68 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  21.45 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.76 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  20.3 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  22.69 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  23.58 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  20.79 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.17 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  23.14 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  23.14 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  23.14 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  22.66 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  25 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  20.52 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.79 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  20 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  22.04 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  20.35 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  20.35 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  20.35 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  23.93 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  19.16 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  24.36 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  25.53 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  22.66 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  23.08 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  19.56 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  20.65 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.58 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.32 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  22.17 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  22.81 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  22.81 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  19.56 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.65 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>