More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5208 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5208  type III secretion FHIPEP protein  100 
 
 		 691 aa  1371    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3119  putative membrane low calcium response protein, LcrD, Type III secretion  67.34 
 
 		 692 aa  862    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.376971  hitchhiker  0.0044205 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  37.84 
 
 		 704 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  38.44 
 
 		 705 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  38.77 
 
 		 705 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  41.19 
 
 		 697 aa  412  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  40.58 
 
 		 696 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  36.38 
 
 		 706 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  40.69 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.31 
 
 		 711 aa  369  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  34.35 
 
 		 695 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  37.83 
 
 		 690 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.63 
 
 		 686 aa  365  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  35.05 
 
 		 695 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  35.06 
 
 		 700 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  38.16 
 
 		 685 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  36.66 
 
 		 694 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  34.7 
 
 		 675 aa  360  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.48 
 
 		 709 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  38.01 
 
 		 685 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  33.87 
 
 		 708 aa  360  7e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  38.92 
 
 		 658 aa  359  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.25 
 
 		 744 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  36.13 
 
 		 682 aa  357  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  36.13 
 
 		 682 aa  357  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  38.38 
 
 		 658 aa  354  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  38.32 
 
 		 687 aa  354  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  39.3 
 
 		 690 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.71 
 
 		 711 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.35 
 
 		 710 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.17 
 
 		 686 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  38.75 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  38.75 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  38.75 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  38.75 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  38.75 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.17 
 
 		 692 aa  348  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.45 
 
 		 692 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 		 699 aa  346  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  39.96 
 
 		 1327 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.95 
 
 		 692 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.05 
 
 		 690 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  33.16 
 
 		 700 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.43 
 
 		 694 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.43 
 
 		 680 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.75 
 
 		 682 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  37.15 
 
 		 681 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.12 
 
 		 680 aa  340  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  37.15 
 
 		 681 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  37.15 
 
 		 681 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  36.99 
 
 		 681 aa  339  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  37.15 
 
 		 681 aa  339  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 697 aa  336  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 690 aa  336  7.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  36.19 
 
 		 685 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.05 
 
 		 686 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  36.19 
 
 		 685 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.46 
 
 		 696 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  36.19 
 
 		 685 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.99 
 
 		 695 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.75 
 
 		 695 aa  333  4e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  36.01 
 
 		 685 aa  333  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  36.01 
 
 		 685 aa  333  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 		 696 aa  333  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.11 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  41 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  41 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  41.18 
 
 		 729 aa  331  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  36.63 
 
 		 705 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  36.63 
 
 		 705 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  40.82 
 
 		 738 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  36.63 
 
 		 705 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.36 
 
 		 710 aa  330  8e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  34.03 
 
 		 686 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.58 
 
 		 720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  37.46 
 
 		 694 aa  329  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  41.59 
 
 		 734 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.81 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.38 
 
 		 705 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  39.89 
 
 		 628 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.51 
 
 		 695 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.13 
 
 		 693 aa  327  6e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.05 
 
 		 700 aa  327  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  34.73 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  34.73 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  34.73 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  34.73 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  34.73 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  34.73 
 
 		 690 aa  326  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.82 
 
 		 745 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.57 
 
 		 698 aa  326  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 693 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.86 
 
 		 709 aa  325  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.09 
 
 		 694 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  34.68 
 
 		 702 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.39 
 
 		 697 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.05 
 
 		 681 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.89 
 
 		 678 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.22 
 
 		 702 aa  322  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.33 
 
 		 696 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>