More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1891 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  63.95 
 
 
695 aa  854    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  64.33 
 
 
694 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  64.01 
 
 
695 aa  855    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  81.34 
 
 
700 aa  1132    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  100 
 
 
700 aa  1410    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  42.56 
 
 
704 aa  544  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  41.22 
 
 
705 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  40.66 
 
 
705 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  41.94 
 
 
682 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  41.94 
 
 
682 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  41.47 
 
 
706 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  38.83 
 
 
685 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  39.03 
 
 
685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  38.85 
 
 
697 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  37.09 
 
 
708 aa  450  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  37.87 
 
 
696 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  37.1 
 
 
675 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.33 
 
 
681 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.33 
 
 
681 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  37.46 
 
 
685 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.33 
 
 
681 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  37.46 
 
 
685 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.33 
 
 
681 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  37.46 
 
 
685 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  37.46 
 
 
685 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  37.46 
 
 
685 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  37.41 
 
 
658 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.33 
 
 
681 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  37.83 
 
 
684 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.84 
 
 
686 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  36.01 
 
 
686 aa  412  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  37.2 
 
 
658 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  36.99 
 
 
690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  36.39 
 
 
690 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  36.39 
 
 
690 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  36.39 
 
 
690 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  36.39 
 
 
690 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  36.39 
 
 
690 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  38.7 
 
 
690 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  36.48 
 
 
1327 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.25 
 
 
692 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.68 
 
 
692 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  37.34 
 
 
705 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  37.34 
 
 
705 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  37.34 
 
 
705 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  35.3 
 
 
687 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.25 
 
 
696 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  35.93 
 
 
702 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  36 
 
 
708 aa  382  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  37.11 
 
 
628 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.33 
 
 
694 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.19 
 
 
702 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.11 
 
 
695 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  35.35 
 
 
690 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  35.35 
 
 
690 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  35.35 
 
 
690 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  35.35 
 
 
690 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  35.35 
 
 
690 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  35.35 
 
 
690 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.96 
 
 
695 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.72 
 
 
694 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  35.32 
 
 
691 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.65 
 
 
703 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.01 
 
 
710 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 
697 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 
686 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.47 
 
 
699 aa  363  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.82 
 
 
686 aa  362  9e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 
680 aa  362  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.51 
 
 
700 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.05 
 
 
702 aa  362  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.1 
 
 
693 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.23 
 
 
690 aa  361  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.41 
 
 
708 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.67 
 
 
690 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  35.9 
 
 
729 aa  361  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  35.09 
 
 
734 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  35.22 
 
 
738 aa  360  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.45 
 
 
689 aa  359  7e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  34.75 
 
 
739 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  34.75 
 
 
739 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.9 
 
 
705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.09 
 
 
711 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.49 
 
 
692 aa  356  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.48 
 
 
699 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 
699 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.78 
 
 
693 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.97 
 
 
690 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.16 
 
 
692 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.61 
 
 
699 aa  355  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.17 
 
 
699 aa  355  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.34 
 
 
697 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.9 
 
 
699 aa  353  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.09 
 
 
686 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.65 
 
 
697 aa  349  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0724  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.4 
 
 
723 aa  349  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0457553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.92 
 
 
699 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.66 
 
 
700 aa  347  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.88 
 
 
699 aa  346  7e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.88 
 
 
699 aa  346  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>