More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1997 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  59.12 
 
 		 690 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  100 
 
 		 705 aa  1399    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  63.58 
 
 		 658 aa  821    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  68.89 
 
 		 690 aa  932    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  99.72 
 
 		 705 aa  1397    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  68.75 
 
 		 1327 aa  928    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  68.47 
 
 		 690 aa  925    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  66.43 
 
 		 684 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  58.49 
 
 		 628 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  62.87 
 
 		 658 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  68.89 
 
 		 690 aa  933    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  68.89 
 
 		 690 aa  932    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  99.86 
 
 		 705 aa  1398    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  68.75 
 
 		 690 aa  932    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  55.81 
 
 		 687 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  68.89 
 
 		 690 aa  933    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  39.89 
 
 		 704 aa  512  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  41.68 
 
 		 697 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  41.36 
 
 		 696 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  39.22 
 
 		 705 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  39.08 
 
 		 705 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  40.28 
 
 		 682 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  44.16 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  40.28 
 
 		 682 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  44.16 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  44.08 
 
 		 738 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  38.71 
 
 		 708 aa  465  1e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  39.4 
 
 		 685 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  39.54 
 
 		 685 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  40 
 
 		 706 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  44.32 
 
 		 729 aa  452  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  43.56 
 
 		 734 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  36.4 
 
 		 675 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  38.01 
 
 		 695 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  43.14 
 
 		 749 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  37.65 
 
 		 695 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  37.29 
 
 		 700 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  37.34 
 
 		 700 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  37.55 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  37.55 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  37.55 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  37.55 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  37.55 
 
 		 681 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  37.29 
 
 		 694 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  35.02 
 
 		 685 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  35.02 
 
 		 685 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.93 
 
 		 686 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  35.44 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  35.02 
 
 		 685 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  35.02 
 
 		 685 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  35.69 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.61 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.32 
 
 		 695 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.27 
 
 		 694 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.4 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.18 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.12 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.09 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 696 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  36.06 
 
 		 691 aa  364  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.77 
 
 		 692 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.82 
 
 		 703 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.89 
 
 		 676 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.93 
 
 		 690 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.1 
 
 		 706 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.98 
 
 		 689 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.05 
 
 		 697 aa  346  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.12 
 
 		 687 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.47 
 
 		 702 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.57 
 
 		 693 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  32.73 
 
 		 697 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 		 696 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  32.45 
 
 		 697 aa  340  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.22 
 
 		 673 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 		 693 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.14 
 
 		 686 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.58 
 
 		 711 aa  336  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.03 
 
 		 702 aa  335  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.63 
 
 		 705 aa  333  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.47 
 
 		 692 aa  333  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.1 
 
 		 700 aa  333  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3119  putative membrane low calcium response protein, LcrD, Type III secretion  36.54 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.376971  hitchhiker  0.0044205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.71 
 
 		 674 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.49 
 
 		 690 aa  331  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.02 
 
 		 697 aa  330  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.61 
 
 		 698 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.59 
 
 		 699 aa  330  7e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  33 
 
 		 708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.84 
 
 		 710 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  33 
 
 		 708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.24 
 
 		 698 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.45 
 
 		 699 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.45 
 
 		 699 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.23 
 
 		 699 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.91 
 
 		 699 aa  327  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.06 
 
 		 697 aa  327  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.15 
 
 		 699 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.81 
 
 		 681 aa  327  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.49 
 
 		 699 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>