More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2206 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  63.4 
 
 		 694 aa  843    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  64.71 
 
 		 695 aa  885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  65.32 
 
 		 695 aa  893    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  81.34 
 
 		 700 aa  1132    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  100 
 
 		 700 aa  1416    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  41.18 
 
 		 705 aa  547  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  41.06 
 
 		 705 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  40.99 
 
 		 704 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  40.57 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  40.48 
 
 		 685 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  40.71 
 
 		 682 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  40.71 
 
 		 682 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  40.61 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  38.69 
 
 		 697 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  36.4 
 
 		 708 aa  450  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  37.72 
 
 		 675 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  38.36 
 
 		 696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  37.41 
 
 		 684 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  38.94 
 
 		 685 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  38.94 
 
 		 685 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  38.9 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  38.94 
 
 		 685 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  38.9 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  36.87 
 
 		 686 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.15 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.15 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.15 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.15 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.15 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.68 
 
 		 686 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  36.4 
 
 		 658 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  36.91 
 
 		 690 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  36.51 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  36.51 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  36.51 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  36.51 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  36.51 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  36.56 
 
 		 1327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  38.37 
 
 		 690 aa  405  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  37.39 
 
 		 702 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  36.47 
 
 		 658 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  36.4 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  36.4 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  36.4 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  36.4 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  36.4 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  36.4 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  35.41 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  36.31 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  36.46 
 
 		 705 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  37.29 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.26 
 
 		 695 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.17 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.69 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.67 
 
 		 696 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  36.05 
 
 		 628 aa  379  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 694 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  35.22 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.36 
 
 		 699 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 		 703 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.33 
 
 		 702 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.27 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.68 
 
 		 708 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 697 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.86 
 
 		 697 aa  369  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.35 
 
 		 705 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.67 
 
 		 690 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 695 aa  369  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.96 
 
 		 710 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.41 
 
 		 700 aa  366  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.37 
 
 		 709 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.53 
 
 		 699 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.75 
 
 		 699 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.67 
 
 		 699 aa  361  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.29 
 
 		 686 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.71 
 
 		 692 aa  360  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  35.51 
 
 		 729 aa  360  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.19 
 
 		 711 aa  359  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.65 
 
 		 690 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.76 
 
 		 706 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.06 
 
 		 699 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.46 
 
 		 699 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.25 
 
 		 709 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.26 
 
 		 699 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.26 
 
 		 699 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.1 
 
 		 709 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.76 
 
 		 708 aa  357  5.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.67 
 
 		 709 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.99 
 
 		 686 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 690 aa  355  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.67 
 
 		 748 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.21 
 
 		 699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.12 
 
 		 699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.86 
 
 		 700 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 699 aa  353  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.21 
 
 		 699 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.21 
 
 		 699 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.52 
 
 		 697 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 		 699 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.28 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>