More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1929 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  100 
 
 		 681 aa  1366    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  100 
 
 		 681 aa  1366    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  54.91 
 
 		 685 aa  699    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  100 
 
 		 681 aa  1366    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  99.71 
 
 		 681 aa  1364    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  58.1 
 
 		 682 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  53.7 
 
 		 685 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  58.1 
 
 		 682 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  99.41 
 
 		 681 aa  1362    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  48.56 
 
 		 675 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  42.28 
 
 		 705 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  40.43 
 
 		 704 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  42.01 
 
 		 705 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  40.74 
 
 		 697 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  40.31 
 
 		 696 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  40.63 
 
 		 690 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  39.71 
 
 		 708 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  39.76 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  39.76 
 
 		 690 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  39.61 
 
 		 1327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  39.76 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  39.76 
 
 		 690 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  39.61 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  40.26 
 
 		 706 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  38.15 
 
 		 700 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  37.25 
 
 		 686 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  38.22 
 
 		 686 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  38.33 
 
 		 700 aa  432  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  38.62 
 
 		 695 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  38.16 
 
 		 694 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  37.5 
 
 		 702 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  37.12 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  37.12 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  37.12 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  37.52 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  37.12 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  37.12 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  37.12 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  38.2 
 
 		 684 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  38.51 
 
 		 658 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  38.76 
 
 		 687 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.58 
 
 		 695 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  37.63 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  38.7 
 
 		 628 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  37.55 
 
 		 705 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  37.55 
 
 		 705 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  37.55 
 
 		 705 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  38.88 
 
 		 690 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.98 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 697 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  35.67 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  35.86 
 
 		 738 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  35.67 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  35.61 
 
 		 729 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.45 
 
 		 694 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  35.96 
 
 		 734 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.47 
 
 		 695 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.79 
 
 		 699 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.28 
 
 		 710 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.14 
 
 		 693 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.63 
 
 		 692 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.32 
 
 		 696 aa  359  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  359  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 		 708 aa  359  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.09 
 
 		 700 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.63 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  33.43 
 
 		 691 aa  356  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.49 
 
 		 702 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.93 
 
 		 690 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.92 
 
 		 697 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.84 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.85 
 
 		 697 aa  352  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.55 
 
 		 699 aa  351  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.55 
 
 		 699 aa  351  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.99 
 
 		 699 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.67 
 
 		 693 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.81 
 
 		 694 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 692 aa  350  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  35.67 
 
 		 749 aa  350  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.04 
 
 		 705 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.64 
 
 		 706 aa  348  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.12 
 
 		 698 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.5 
 
 		 673 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.81 
 
 		 700 aa  347  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  35.88 
 
 		 696 aa  346  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.23 
 
 		 700 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.32 
 
 		 697 aa  345  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.45 
 
 		 681 aa  343  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.47 
 
 		 699 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>