More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1402 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  100 
 
 		 695 aa  1414    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  92.66 
 
 		 695 aa  1322    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  78.29 
 
 		 694 aa  1076    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  64.71 
 
 		 700 aa  885    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  63.95 
 
 		 700 aa  854    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  41.27 
 
 		 705 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  40.95 
 
 		 705 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  40.69 
 
 		 704 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  39.89 
 
 		 685 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  40.03 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  38.37 
 
 		 675 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  40.92 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  40.92 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  39.72 
 
 		 706 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  38.71 
 
 		 697 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  38.19 
 
 		 696 aa  439  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  40.5 
 
 		 684 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  38.65 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  38.65 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  38.65 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  38.65 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  38.65 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  39.64 
 
 		 658 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  38.38 
 
 		 686 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  34.31 
 
 		 708 aa  414  1e-114  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  38.69 
 
 		 690 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  38.9 
 
 		 690 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  38.69 
 
 		 690 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  38.69 
 
 		 690 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  38.69 
 
 		 690 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  38.69 
 
 		 690 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.62 
 
 		 681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.62 
 
 		 681 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  38.88 
 
 		 1327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.62 
 
 		 681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.62 
 
 		 681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  37.72 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  38.01 
 
 		 705 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.62 
 
 		 681 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  38.01 
 
 		 705 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.84 
 
 		 686 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  38.01 
 
 		 705 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  39.19 
 
 		 658 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  36.35 
 
 		 702 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  37.06 
 
 		 687 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  35.79 
 
 		 691 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 		 695 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  36.77 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  36.77 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  36.77 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  36.77 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  36.77 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.85 
 
 		 703 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  36.77 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.77 
 
 		 697 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.95 
 
 		 693 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  36.69 
 
 		 628 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.78 
 
 		 695 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.34 
 
 		 690 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 		 694 aa  372  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.58 
 
 		 702 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.71 
 
 		 697 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.2 
 
 		 692 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.1 
 
 		 699 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.36 
 
 		 699 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.18 
 
 		 710 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.06 
 
 		 699 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.45 
 
 		 692 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 		 692 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  35.7 
 
 		 738 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 		 694 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.15 
 
 		 693 aa  363  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  35.37 
 
 		 739 aa  363  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  35.37 
 
 		 739 aa  363  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  35.47 
 
 		 729 aa  361  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.86 
 
 		 690 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.1 
 
 		 686 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.37 
 
 		 698 aa  360  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.76 
 
 		 697 aa  359  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.97 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 		 693 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.65 
 
 		 700 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.5 
 
 		 686 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 699 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 699 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  36.47 
 
 		 734 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 		 700 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.27 
 
 		 693 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.18 
 
 		 698 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 		 700 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.48 
 
 		 699 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  353  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.01 
 
 		 699 aa  353  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.46 
 
 		 680 aa  352  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.41 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.46 
 
 		 690 aa  351  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 		 699 aa  351  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.26 
 
 		 684 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.26 
 
 		 684 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>