More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5063 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  50.52 
 
 		 685 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  50.66 
 
 		 685 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  100 
 
 		 675 aa  1362    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  49.02 
 
 		 682 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  49.02 
 
 		 682 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  48.41 
 
 		 681 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  48.56 
 
 		 681 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  48.56 
 
 		 681 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  48.56 
 
 		 681 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  48.41 
 
 		 681 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  44.59 
 
 		 705 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  44.98 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  42.47 
 
 		 704 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  42.22 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  41.27 
 
 		 706 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  41.61 
 
 		 686 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  40.65 
 
 		 684 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  39.79 
 
 		 697 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  38.68 
 
 		 658 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  39.1 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  39.06 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  39.42 
 
 		 696 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  39.26 
 
 		 708 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  38.59 
 
 		 685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  38.59 
 
 		 685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  38.59 
 
 		 685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  38.4 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  38.77 
 
 		 690 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  38.77 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  38.37 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  38.77 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  38.6 
 
 		 1327 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  38.77 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  38.77 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  37.72 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  38.77 
 
 		 658 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  40.06 
 
 		 702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  38.03 
 
 		 687 aa  438  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  37.1 
 
 		 700 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  38.52 
 
 		 690 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  37.5 
 
 		 694 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.3 
 
 		 695 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  36.11 
 
 		 705 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  36.11 
 
 		 705 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  36.11 
 
 		 705 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.98 
 
 		 695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.77 
 
 		 696 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  37.05 
 
 		 628 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.31 
 
 		 696 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.42 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.77 
 
 		 694 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 		 694 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.57 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.54 
 
 		 692 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.2 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.75 
 
 		 681 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 697 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.44 
 
 		 690 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.85 
 
 		 689 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  33.24 
 
 		 738 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  33.19 
 
 		 739 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.54 
 
 		 700 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  33.19 
 
 		 739 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  34.57 
 
 		 691 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.68 
 
 		 708 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.4 
 
 		 708 aa  364  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  33.67 
 
 		 729 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 699 aa  360  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  33.9 
 
 		 734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.92 
 
 		 710 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 		 699 aa  357  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.92 
 
 		 697 aa  357  5e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.16 
 
 		 680 aa  356  6.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.81 
 
 		 694 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.7 
 
 		 711 aa  353  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.67 
 
 		 690 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.78 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.99 
 
 		 702 aa  351  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.76 
 
 		 680 aa  351  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.3 
 
 		 699 aa  351  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.87 
 
 		 703 aa  349  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.77 
 
 		 690 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.56 
 
 		 686 aa  349  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.23 
 
 		 699 aa  349  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.67 
 
 		 676 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 697 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.75 
 
 		 705 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 717 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 687 aa  347  4e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.44 
 
 		 699 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.1 
 
 		 703 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.8 
 
 		 679 aa  346  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 		 703 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  33.67 
 
 		 749 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.85 
 
 		 696 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.95 
 
 		 693 aa  343  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.58 
 
 		 699 aa  342  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.05 
 
 		 720 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>