More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4753 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  100 
 
 		 734 aa  1454    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  94.86 
 
 		 739 aa  1333    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  98.77 
 
 		 749 aa  1437    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  94.86 
 
 		 739 aa  1333    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  93.61 
 
 		 729 aa  1277    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  94.59 
 
 		 738 aa  1324    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  47.18 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  47.18 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  47.18 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  47.25 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  47.18 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  47.17 
 
 		 1327 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  46.88 
 
 		 690 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  44.52 
 
 		 687 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  44.69 
 
 		 684 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  40.51 
 
 		 704 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  39.18 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  44.86 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  44.26 
 
 		 658 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  39.32 
 
 		 705 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  43.82 
 
 		 658 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  42.96 
 
 		 705 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  42.96 
 
 		 705 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  42.96 
 
 		 705 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  40.96 
 
 		 697 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  39.06 
 
 		 708 aa  458  1e-127  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  40.06 
 
 		 696 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  41.37 
 
 		 706 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  43.61 
 
 		 628 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  35.09 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  33.9 
 
 		 675 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  35.96 
 
 		 681 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  36.11 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  35.82 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  35.82 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  37.36 
 
 		 685 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  35.82 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  36.47 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  37.21 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  35.48 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.39 
 
 		 694 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  35.34 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  35.73 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.59 
 
 		 695 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  34.65 
 
 		 686 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  35.49 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.62 
 
 		 692 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  35.49 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.33 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.92 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  34.27 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  34.27 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  34.27 
 
 		 685 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  34.27 
 
 		 685 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  34.27 
 
 		 685 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.33 
 
 		 695 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.44 
 
 		 692 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 		 696 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.17 
 
 		 693 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 694 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.88 
 
 		 690 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  34.99 
 
 		 691 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.58 
 
 		 697 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.87 
 
 		 690 aa  365  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.48 
 
 		 693 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.45 
 
 		 694 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.8 
 
 		 699 aa  362  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.79 
 
 		 702 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.32 
 
 		 673 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.9 
 
 		 680 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.62 
 
 		 710 aa  359  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.01 
 
 		 695 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.28 
 
 		 705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.59 
 
 		 708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.88 
 
 		 689 aa  357  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 		 676 aa  356  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.62 
 
 		 700 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.58 
 
 		 692 aa  353  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.66 
 
 		 703 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.16 
 
 		 686 aa  351  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 702 aa  351  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.16 
 
 		 681 aa  350  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.18 
 
 		 699 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.47 
 
 		 677 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.18 
 
 		 700 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.49 
 
 		 709 aa  347  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.43 
 
 		 690 aa  347  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.93 
 
 		 707 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.76 
 
 		 674 aa  346  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.43 
 
 		 697 aa  345  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.61 
 
 		 715 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.52 
 
 		 698 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.65 
 
 		 707 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.29 
 
 		 700 aa  345  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.08 
 
 		 696 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.96 
 
 		 700 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 697 aa  344  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.57 
 
 		 692 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.85 
 
 		 698 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>