More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2392 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.66 
 
 
688 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.25 
 
 
696 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.47 
 
 
695 aa  674    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.43 
 
 
684 aa  729    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 
682 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
690 aa  1385    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.28 
 
 
692 aa  684    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.14 
 
 
692 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.59 
 
 
689 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.34 
 
 
676 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.51 
 
 
686 aa  722    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.95 
 
 
694 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.1 
 
 
688 aa  892    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.03 
 
 
690 aa  793    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.41 
 
 
692 aa  837    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.37 
 
 
679 aa  646    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
674 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.38 
 
 
686 aa  701    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.86 
 
 
708 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.61 
 
 
695 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.43 
 
 
692 aa  684    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
694 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  48 
 
 
696 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.44 
 
 
673 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.63 
 
 
694 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.66 
 
 
697 aa  625  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.3 
 
 
678 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.85 
 
 
702 aa  615  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 
681 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.58 
 
 
695 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.13 
 
 
680 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.72 
 
 
678 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.57 
 
 
678 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.59 
 
 
677 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
706 aa  596  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.96 
 
 
696 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0405  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
712 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.14 
 
 
681 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.75 
 
 
697 aa  589  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
703 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.93 
 
 
717 aa  586  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.41 
 
 
703 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.1 
 
 
693 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
703 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.41 
 
 
680 aa  582  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
703 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  45.55 
 
 
696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.04 
 
 
697 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.04 
 
 
693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1398  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 
710 aa  575  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.07 
 
 
690 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.67 
 
 
698 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.9 
 
 
692 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.78 
 
 
708 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.78 
 
 
708 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.79 
 
 
699 aa  572  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.33 
 
 
695 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.28 
 
 
708 aa  571  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.82 
 
 
711 aa  572  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.15 
 
 
697 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.98 
 
 
698 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.62 
 
 
700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.6 
 
 
686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.78 
 
 
702 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.25 
 
 
699 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.02 
 
 
699 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.02 
 
 
699 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.09 
 
 
699 aa  561  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.18 
 
 
699 aa  558  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  45.77 
 
 
694 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.05 
 
 
700 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.07 
 
 
699 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.07 
 
 
699 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.07 
 
 
699 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.51 
 
 
687 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.92 
 
 
700 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.05 
 
 
710 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.23 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.23 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.03 
 
 
684 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.11 
 
 
694 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.08 
 
 
699 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.08 
 
 
700 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.64 
 
 
680 aa  552  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.05 
 
 
700 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.07 
 
 
699 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.08 
 
 
700 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.03 
 
 
684 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.08 
 
 
700 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.98 
 
 
700 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.11 
 
 
694 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.18 
 
 
699 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>