More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5428 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  93.63 
 
 
729 aa  1285    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  100 
 
 
738 aa  1459    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  99.59 
 
 
739 aa  1399    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  94.45 
 
 
749 aa  1271    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  99.59 
 
 
739 aa  1399    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  94.59 
 
 
734 aa  1308    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  46.83 
 
 
690 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  46.83 
 
 
690 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  46.83 
 
 
690 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  46.46 
 
 
690 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  46.83 
 
 
690 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  46.83 
 
 
690 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  46.75 
 
 
1327 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  45.07 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  44.41 
 
 
687 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  40.4 
 
 
704 aa  505  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  40.14 
 
 
705 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  39.58 
 
 
705 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  43.68 
 
 
658 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  44.43 
 
 
690 aa  482  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  43.48 
 
 
705 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  43.48 
 
 
705 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  43.48 
 
 
705 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  43.02 
 
 
658 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  41.14 
 
 
697 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  39.14 
 
 
708 aa  459  1e-127  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  40.46 
 
 
696 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  41.61 
 
 
706 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  43.57 
 
 
628 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  37.5 
 
 
685 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  37.39 
 
 
685 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  35.86 
 
 
681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  35.86 
 
 
681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  35.86 
 
 
681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  35.78 
 
 
695 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  35.58 
 
 
681 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  35.58 
 
 
681 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  33.24 
 
 
675 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  35.99 
 
 
682 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  35.99 
 
 
682 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  35.7 
 
 
695 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  35.22 
 
 
700 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.42 
 
 
694 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  35.6 
 
 
686 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.67 
 
 
686 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.43 
 
 
695 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.65 
 
 
692 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  34.08 
 
 
685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  34.08 
 
 
685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  34.08 
 
 
685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  34.08 
 
 
685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  35.55 
 
 
694 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.65 
 
 
692 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  34.08 
 
 
685 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.31 
 
 
695 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 
696 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.43 
 
 
694 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.47 
 
 
692 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  34.17 
 
 
686 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.49 
 
 
693 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 
694 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.64 
 
 
690 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.31 
 
 
708 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.13 
 
 
705 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.12 
 
 
702 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.48 
 
 
697 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.43 
 
 
673 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 
690 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  33.97 
 
 
691 aa  363  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.15 
 
 
693 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 
699 aa  363  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.41 
 
 
676 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.99 
 
 
680 aa  362  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.14 
 
 
695 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.04 
 
 
710 aa  360  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.23 
 
 
689 aa  359  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 
700 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.39 
 
 
692 aa  357  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.44 
 
 
681 aa  356  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.23 
 
 
690 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.94 
 
 
700 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.26 
 
 
696 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 
678 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.29 
 
 
707 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.78 
 
 
690 aa  350  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 
678 aa  350  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.4 
 
 
711 aa  350  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.34 
 
 
674 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 
700 aa  350  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.43 
 
 
684 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.43 
 
 
684 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.24 
 
 
707 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.39 
 
 
700 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.61 
 
 
697 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 
692 aa  348  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 
703 aa  348  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.51 
 
 
708 aa  348  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 
702 aa  348  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.06 
 
 
700 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.06 
 
 
700 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>