More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0119 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  100 
 
 		 691 aa  1398    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  37.02 
 
 		 705 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  37.72 
 
 		 704 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  36.35 
 
 		 705 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  35.4 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  35.71 
 
 		 697 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  37.16 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  37.16 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  37.09 
 
 		 690 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  37.16 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  37.01 
 
 		 690 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  35.76 
 
 		 695 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  37.01 
 
 		 690 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  36.91 
 
 		 706 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  35.51 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  35.21 
 
 		 700 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  36.81 
 
 		 1327 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  35.51 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  35.3 
 
 		 700 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  35.6 
 
 		 696 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  34.55 
 
 		 675 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 		 690 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  35.63 
 
 		 685 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  35.8 
 
 		 685 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  33.43 
 
 		 686 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  35.33 
 
 		 694 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  36.23 
 
 		 685 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  36.08 
 
 		 685 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  36.08 
 
 		 685 aa  361  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  36.08 
 
 		 685 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  36.08 
 
 		 685 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  34.9 
 
 		 684 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  33.48 
 
 		 708 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  33.43 
 
 		 681 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  35.47 
 
 		 658 aa  353  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  33.43 
 
 		 681 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  33.43 
 
 		 681 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  33.28 
 
 		 681 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  33.43 
 
 		 681 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  36.08 
 
 		 690 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  33.28 
 
 		 686 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.46 
 
 		 680 aa  343  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  35.14 
 
 		 705 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.93 
 
 		 692 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  35.14 
 
 		 705 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  35.42 
 
 		 705 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  36.9 
 
 		 628 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  33.57 
 
 		 738 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  33.52 
 
 		 739 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  33.52 
 
 		 739 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.93 
 
 		 699 aa  334  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.28 
 
 		 693 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  34.92 
 
 		 729 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.25 
 
 		 686 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  34.71 
 
 		 734 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.09 
 
 		 710 aa  330  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.98 
 
 		 703 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  32.54 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.88 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.32 
 
 		 695 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  32.4 
 
 		 697 aa  326  7e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.39 
 
 		 699 aa  326  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.57 
 
 		 689 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 698 aa  325  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.34 
 
 		 699 aa  324  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.92 
 
 		 690 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.97 
 
 		 700 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.93 
 
 		 697 aa  323  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.36 
 
 		 702 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.54 
 
 		 698 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.76 
 
 		 702 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.44 
 
 		 694 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.99 
 
 		 680 aa  320  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  30.07 
 
 		 692 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.77 
 
 		 694 aa  319  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 698 aa  318  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.43 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 694 aa  318  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.58 
 
 		 700 aa  318  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.3 
 
 		 699 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.55 
 
 		 693 aa  316  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.29 
 
 		 699 aa  316  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.15 
 
 		 699 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.15 
 
 		 699 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.1 
 
 		 699 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.05 
 
 		 711 aa  315  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.49 
 
 		 699 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.49 
 
 		 699 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.5 
 
 		 699 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.7 
 
 		 684 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.7 
 
 		 684 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.25 
 
 		 699 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  29.69 
 
 		 692 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.71 
 
 		 720 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.63 
 
 		 706 aa  313  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  34.38 
 
 		 749 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.39 
 
 		 699 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  33.68 
 
 		 687 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  33.13 
 
 		 694 aa  312  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.67 
 
 		 686 aa  311  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>