More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0452 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  57.47 
 
 		 690 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  55.81 
 
 		 705 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  57.5 
 
 		 690 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  57.5 
 
 		 690 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  57.36 
 
 		 690 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  57.5 
 
 		 690 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  56.53 
 
 		 628 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  55.81 
 
 		 705 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  57.36 
 
 		 1327 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  56.91 
 
 		 690 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  55.81 
 
 		 705 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  58.63 
 
 		 684 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  57.5 
 
 		 690 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  54.87 
 
 		 658 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  54.28 
 
 		 658 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  100 
 
 		 687 aa  1374    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  43.16 
 
 		 705 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  42.74 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  41.45 
 
 		 704 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  42.56 
 
 		 697 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  41.58 
 
 		 696 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  44.52 
 
 		 734 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  44.49 
 
 		 739 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  44.49 
 
 		 739 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  44.41 
 
 		 738 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  40.67 
 
 		 708 aa  488  1e-136  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  41.06 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  44.19 
 
 		 729 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  43.19 
 
 		 706 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  44.74 
 
 		 749 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  40.18 
 
 		 685 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  40.26 
 
 		 682 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  40.26 
 
 		 682 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  38.03 
 
 		 675 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.95 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  37.85 
 
 		 695 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.76 
 
 		 681 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  35.41 
 
 		 700 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.61 
 
 		 681 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.76 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.76 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.76 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  37.06 
 
 		 695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  36.42 
 
 		 685 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  36.42 
 
 		 685 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  36.42 
 
 		 685 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  36.42 
 
 		 685 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  35.3 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.61 
 
 		 694 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  36.42 
 
 		 685 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.5 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.53 
 
 		 686 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.35 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.3 
 
 		 695 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  37.54 
 
 		 694 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.65 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 		 694 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.41 
 
 		 696 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  34.76 
 
 		 686 aa  379  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.53 
 
 		 690 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.86 
 
 		 676 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.07 
 
 		 690 aa  364  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.03 
 
 		 687 aa  363  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.78 
 
 		 696 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.5 
 
 		 697 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.82 
 
 		 706 aa  351  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.43 
 
 		 693 aa  350  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.86 
 
 		 674 aa  347  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 689 aa  347  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.48 
 
 		 717 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.95 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.08 
 
 		 681 aa  343  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.22 
 
 		 692 aa  343  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.95 
 
 		 700 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.44 
 
 		 673 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.48 
 
 		 711 aa  341  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5208  type III secretion FHIPEP protein  37.48 
 
 		 691 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 720 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.7 
 
 		 678 aa  340  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.26 
 
 		 693 aa  340  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.7 
 
 		 702 aa  339  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 678 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.66 
 
 		 694 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.85 
 
 		 708 aa  336  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.51 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.51 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.98 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.98 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.51 
 
 		 699 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.87 
 
 		 690 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.68 
 
 		 677 aa  334  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.7 
 
 		 700 aa  334  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.28 
 
 		 697 aa  334  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.74 
 
 		 699 aa  334  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.36 
 
 		 699 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 680 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.19 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.83 
 
 		 699 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.87 
 
 		 708 aa  331  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.3 
 
 		 703 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>