More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1438 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.46 
 
 
678 aa  941    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.6 
 
 
678 aa  942    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1398  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.43 
 
 
710 aa  764    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.74 
 
 
687 aa  920    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
686 aa  644    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
680 aa  1341    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.92 
 
 
695 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.2 
 
 
679 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.42 
 
 
689 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
692 aa  587  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.49 
 
 
676 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.76 
 
 
686 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.49 
 
 
695 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.64 
 
 
690 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.92 
 
 
703 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.33 
 
 
697 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.83 
 
 
696 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.61 
 
 
692 aa  572  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.45 
 
 
674 aa  568  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.45 
 
 
694 aa  572  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.27 
 
 
688 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.53 
 
 
681 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.93 
 
 
694 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.74 
 
 
690 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.31 
 
 
693 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.21 
 
 
694 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.1 
 
 
682 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.72 
 
 
678 aa  554  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.38 
 
 
703 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.39 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.88 
 
 
703 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.93 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.84 
 
 
696 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.38 
 
 
695 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.41 
 
 
706 aa  548  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.27 
 
 
703 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
677 aa  544  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
697 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.54 
 
 
700 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.28 
 
 
688 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.59 
 
 
708 aa  541  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.35 
 
 
673 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.81 
 
 
690 aa  532  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.89 
 
 
693 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.9 
 
 
690 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.64 
 
 
695 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.3 
 
 
711 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.65 
 
 
699 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.96 
 
 
700 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.94 
 
 
700 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.96 
 
 
697 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
699 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.56 
 
 
700 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.15 
 
 
698 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1651  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.88 
 
 
693 aa  525  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0916623  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.15 
 
 
708 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.15 
 
 
708 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.92 
 
 
702 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.63 
 
 
681 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.42 
 
 
724 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.32 
 
 
699 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.13 
 
 
700 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.57 
 
 
699 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.57 
 
 
699 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.35 
 
 
696 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.26 
 
 
699 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.2 
 
 
698 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.56 
 
 
692 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  43.09 
 
 
696 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.69 
 
 
699 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.5 
 
 
680 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.81 
 
 
692 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.06 
 
 
692 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
699 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.69 
 
 
699 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.34 
 
 
697 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.77 
 
 
717 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.16 
 
 
700 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
699 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.04 
 
 
699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.33 
 
 
695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.75 
 
 
694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.67 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.49 
 
 
710 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.75 
 
 
694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0941  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.74 
 
 
719 aa  514  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.653874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.68 
 
 
702 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0724  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.63 
 
 
723 aa  515  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0457553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.09 
 
 
699 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.74 
 
 
730 aa  512  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.81 
 
 
699 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>