More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03403 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  61.19 
 
 		 684 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  61.88 
 
 		 690 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  62.36 
 
 		 658 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  58.49 
 
 		 705 aa  705    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  61.9 
 
 		 690 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  61.9 
 
 		 690 aa  780    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  62.05 
 
 		 690 aa  781    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  62.05 
 
 		 690 aa  781    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  58.64 
 
 		 705 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  62.2 
 
 		 1327 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  62.65 
 
 		 690 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  100 
 
 		 628 aa  1259    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  62.2 
 
 		 690 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  61.9 
 
 		 658 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  58.64 
 
 		 705 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  55.79 
 
 		 687 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  44.04 
 
 		 705 aa  555  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  43.46 
 
 		 705 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  43.37 
 
 		 697 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  41.91 
 
 		 704 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  43.46 
 
 		 696 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  42.29 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  43.71 
 
 		 738 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  40.36 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  40.06 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  43.8 
 
 		 739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  43.8 
 
 		 739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  40.36 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  40.06 
 
 		 685 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  38.6 
 
 		 708 aa  451  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  43.91 
 
 		 734 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  37.11 
 
 		 675 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  43.85 
 
 		 729 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  37.26 
 
 		 700 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  43.76 
 
 		 749 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  36.2 
 
 		 700 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.7 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.7 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.55 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.7 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  37.26 
 
 		 695 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  37.95 
 
 		 681 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  36.73 
 
 		 695 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  36.81 
 
 		 685 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  36.81 
 
 		 685 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  36.81 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  36.73 
 
 		 686 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  36.81 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  36.66 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  37.13 
 
 		 686 aa  399  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  37.18 
 
 		 694 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  37.16 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.33 
 
 		 686 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.83 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.83 
 
 		 692 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 		 695 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 		 690 aa  361  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.32 
 
 		 694 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.96 
 
 		 689 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.99 
 
 		 676 aa  350  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.49 
 
 		 696 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.45 
 
 		 695 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.69 
 
 		 694 aa  347  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.12 
 
 		 703 aa  347  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.58 
 
 		 702 aa  347  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.44 
 
 		 692 aa  346  8e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5208  type III secretion FHIPEP protein  39.52 
 
 		 691 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.92 
 
 		 696 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.53 
 
 		 700 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 692 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.74 
 
 		 708 aa  339  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.53 
 
 		 693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.89 
 
 		 693 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.28 
 
 		 706 aa  332  9e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.26 
 
 		 697 aa  332  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.12 
 
 		 694 aa  329  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3119  putative membrane low calcium response protein, LcrD, Type III secretion  37.8 
 
 		 692 aa  329  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.376971  hitchhiker  0.0044205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.79 
 
 		 705 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 687 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.02 
 
 		 708 aa  328  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.8 
 
 		 674 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.71 
 
 		 699 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.85 
 
 		 678 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.14 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.72 
 
 		 700 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.05 
 
 		 699 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.13 
 
 		 700 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.85 
 
 		 678 aa  326  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.75 
 
 		 702 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.23 
 
 		 699 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.23 
 
 		 699 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.22 
 
 		 700 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.54 
 
 		 710 aa  323  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 681 aa  323  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.04 
 
 		 684 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.04 
 
 		 684 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.09 
 
 		 699 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  31.21 
 
 		 697 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.55 
 
 		 699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.58 
 
 		 694 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>