More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3907 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  58.1 
 
 		 681 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  100 
 
 		 682 aa  1380    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  58.1 
 
 		 681 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  58.1 
 
 		 681 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  58.1 
 
 		 681 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  61.04 
 
 		 685 aa  804    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  60.85 
 
 		 685 aa  800    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  49.17 
 
 		 675 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  100 
 
 		 682 aa  1380    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  57.95 
 
 		 681 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  44.77 
 
 		 705 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  44.92 
 
 		 705 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  45.51 
 
 		 704 aa  577  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  45.73 
 
 		 706 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  43.02 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  43.95 
 
 		 696 aa  515  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  41.15 
 
 		 700 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  41.17 
 
 		 690 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  41.8 
 
 		 700 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  40.58 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  39.76 
 
 		 685 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  39.76 
 
 		 685 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  40.44 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  40.58 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  40.58 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  40.58 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  41.21 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  39.76 
 
 		 685 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  39.76 
 
 		 685 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  39.76 
 
 		 685 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  40.59 
 
 		 1327 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  38.68 
 
 		 686 aa  462  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  40.03 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  38.78 
 
 		 684 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  41 
 
 		 687 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  40.92 
 
 		 695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  40.43 
 
 		 705 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  40 
 
 		 705 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  40.29 
 
 		 705 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  41.19 
 
 		 694 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  38.72 
 
 		 686 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  39.91 
 
 		 658 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  39.61 
 
 		 658 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  39.97 
 
 		 702 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  39.63 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  39.63 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  39.63 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  39.63 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  39.63 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  39.63 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.72 
 
 		 695 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  39.46 
 
 		 690 aa  426  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  40.96 
 
 		 628 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.3 
 
 		 702 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.85 
 
 		 689 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  37 
 
 		 690 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.37 
 
 		 696 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.31 
 
 		 695 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.45 
 
 		 686 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 		 692 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 692 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.76 
 
 		 694 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.56 
 
 		 694 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.78 
 
 		 697 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.43 
 
 		 706 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.67 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.01 
 
 		 703 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 		 700 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.67 
 
 		 710 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.37 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 699 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.91 
 
 		 705 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  36.08 
 
 		 738 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.26 
 
 		 676 aa  379  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  36.03 
 
 		 739 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.22 
 
 		 695 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  36.03 
 
 		 739 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.29 
 
 		 699 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.14 
 
 		 699 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.59 
 
 		 699 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  33 
 
 		 699 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  35.36 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.03 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  33 
 
 		 699 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 692 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.51 
 
 		 693 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.77 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.38 
 
 		 697 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.44 
 
 		 711 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.9 
 
 		 700 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.86 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.86 
 
 		 699 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  36.98 
 
 		 729 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.73 
 
 		 692 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.28 
 
 		 697 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.04 
 
 		 699 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.12 
 
 		 703 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>