More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0679 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  60.18 
 
 		 690 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  69.18 
 
 		 705 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  99.86 
 
 		 690 aa  1386    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  99.86 
 
 		 690 aa  1386    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  69.18 
 
 		 705 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  100 
 
 		 1327 aa  2561    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  71.74 
 
 		 684 aa  955    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  99.71 
 
 		 690 aa  1386    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  96.38 
 
 		 690 aa  1342    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  99.71 
 
 		 690 aa  1386    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  100 
 
 		 690 aa  1387    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  68.31 
 
 		 658 aa  892    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  68.42 
 
 		 658 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  69.03 
 
 		 705 aa  882    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  62.31 
 
 		 628 aa  721    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  57.48 
 
 		 687 aa  729    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  42.69 
 
 		 704 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  43.31 
 
 		 705 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  44.54 
 
 		 697 aa  532  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  43.68 
 
 		 705 aa  526  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  44.71 
 
 		 696 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  46.55 
 
 		 738 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  46.28 
 
 		 739 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  43.34 
 
 		 706 aa  476  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  46.28 
 
 		 739 aa  476  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  40.59 
 
 		 682 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  40.59 
 
 		 682 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  46.36 
 
 		 729 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  40.62 
 
 		 685 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  47.17 
 
 		 734 aa  466  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  40.09 
 
 		 708 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  39.82 
 
 		 685 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  46.88 
 
 		 749 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  38.6 
 
 		 675 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  39.61 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  39.61 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  39.61 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  39.61 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  39.61 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  38.24 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  38.24 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  38.24 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  38.24 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  38.24 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  37.44 
 
 		 686 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  36.23 
 
 		 686 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  38.49 
 
 		 695 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.24 
 
 		 695 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  39.29 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  36.56 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.94 
 
 		 686 aa  399  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  36.47 
 
 		 700 aa  393  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  38.43 
 
 		 694 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.03 
 
 		 695 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.19 
 
 		 694 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 692 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  36.38 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 692 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.43 
 
 		 703 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.79 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.94 
 
 		 676 aa  362  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.66 
 
 		 705 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.58 
 
 		 692 aa  360  9e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.23 
 
 		 702 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.16 
 
 		 697 aa  357  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.36 
 
 		 694 aa  355  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.24 
 
 		 696 aa  353  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.1 
 
 		 680 aa  352  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3119  putative membrane low calcium response protein, LcrD, Type III secretion  43.59 
 
 		 692 aa  352  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.376971  hitchhiker  0.0044205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.63 
 
 		 706 aa  352  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.66 
 
 		 693 aa  349  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.15 
 
 		 690 aa  349  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.96 
 
 		 696 aa  348  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.21 
 
 		 700 aa  347  8.999999999999999e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.46 
 
 		 689 aa  347  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.31 
 
 		 687 aa  346  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.21 
 
 		 699 aa  346  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.17 
 
 		 693 aa  344  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.93 
 
 		 690 aa  342  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.13 
 
 		 674 aa  342  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  36.99 
 
 		 696 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 690 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.42 
 
 		 708 aa  340  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 700 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.09 
 
 		 702 aa  338  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.15 
 
 		 692 aa  337  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.61 
 
 		 697 aa  337  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.54 
 
 		 697 aa  337  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.52 
 
 		 707 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.28 
 
 		 673 aa  336  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.52 
 
 		 707 aa  336  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.19 
 
 		 699 aa  336  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.71 
 
 		 699 aa  335  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.71 
 
 		 699 aa  335  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.94 
 
 		 708 aa  335  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.15 
 
 		 710 aa  334  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.94 
 
 		 708 aa  335  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.63 
 
 		 693 aa  335  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.16 
 
 		 679 aa  334  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 697 aa  334  6e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>