More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4179 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01850  flagellar biosynthesis protein A  61.05 
 
 
692 aa  811    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.585433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.19 
 
 
692 aa  830    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1974  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.05 
 
 
692 aa  810    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.37 
 
 
715 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.56 
 
 
696 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.31 
 
 
709 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
694 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  92.66 
 
 
696 aa  1293    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.03 
 
 
699 aa  728    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.03 
 
 
700 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2333  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.35 
 
 
692 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.66 
 
 
707 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.42 
 
 
699 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.28 
 
 
699 aa  727    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.8 
 
 
709 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2073  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.42 
 
 
692 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000742735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.63 
 
 
702 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.3 
 
 
700 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.72 
 
 
692 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.86 
 
 
692 aa  661    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2446  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.85 
 
 
692 aa  807    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.95 
 
 
709 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.64 
 
 
694 aa  840    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.03 
 
 
693 aa  892    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1177  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.97 
 
 
692 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.66 
 
 
692 aa  845    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.42 
 
 
699 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.53 
 
 
692 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.42 
 
 
699 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.62 
 
 
690 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.9 
 
 
709 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.56 
 
 
699 aa  765    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2068  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.42 
 
 
692 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.28 
 
 
699 aa  727    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.53 
 
 
699 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.16 
 
 
694 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1308  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.05 
 
 
692 aa  812    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.201196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.56 
 
 
697 aa  754    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.4 
 
 
684 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1310  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.14 
 
 
692 aa  840    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.933985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2431  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.87 
 
 
692 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2616  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.91 
 
 
692 aa  810    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000268529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.29 
 
 
700 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3078  flagellar biosynthesis protein  57.25 
 
 
700 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.984078  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.65 
 
 
700 aa  857    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.66 
 
 
700 aa  867    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.53 
 
 
699 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1209  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.43 
 
 
692 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.08 
 
 
693 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.32 
 
 
755 aa  684    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.6 
 
 
748 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1753  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.05 
 
 
692 aa  813    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.44 
 
 
690 aa  875    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.76 
 
 
700 aa  870    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.28 
 
 
699 aa  744    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.33 
 
 
699 aa  717    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.67 
 
 
700 aa  830    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.4 
 
 
699 aa  799    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.08 
 
 
695 aa  823    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.41 
 
 
700 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.05 
 
 
695 aa  860    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.09 
 
 
700 aa  770    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.43 
 
 
697 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2937  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.23 
 
 
700 aa  783    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.275075  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.67 
 
 
700 aa  830    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.76 
 
 
700 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2111  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.05 
 
 
692 aa  812    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.56 
 
 
699 aa  733    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.56 
 
 
699 aa  733    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.9 
 
 
706 aa  745    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.7 
 
 
699 aa  699    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.63 
 
 
709 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.71 
 
 
699 aa  704    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.3 
 
 
700 aa  832    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.3 
 
 
692 aa  825    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.52 
 
 
707 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.67 
 
 
700 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.19 
 
 
709 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1332  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.42 
 
 
692 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.42 
 
 
699 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.9 
 
 
700 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.44 
 
 
705 aa  739    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.57 
 
 
695 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.4 
 
 
684 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.4 
 
 
697 aa  741    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.71 
 
 
699 aa  718    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.55 
 
 
724 aa  708    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.28 
 
 
699 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
708 aa  1412    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.91 
 
 
693 aa  803    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.22 
 
 
694 aa  807    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2128  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.42 
 
 
692 aa  784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000657418 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.48 
 
 
700 aa  857    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.75 
 
 
697 aa  766    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>