More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003372 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  100 
 
 		 705 aa  1413    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  73.89 
 
 		 704 aa  1053    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  52.51 
 
 		 696 aa  738    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  94.61 
 
 		 705 aa  1333    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  72.59 
 
 		 706 aa  980    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  53.48 
 
 		 697 aa  741    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  44.31 
 
 		 708 aa  610  1e-173  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  46.85 
 
 		 685 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  46.75 
 
 		 685 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  44.63 
 
 		 682 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  44.63 
 
 		 682 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  44.59 
 
 		 675 aa  570  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  42.9 
 
 		 690 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  41.06 
 
 		 700 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  43.53 
 
 		 690 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  43.39 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  43.39 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  43.39 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  43.19 
 
 		 1327 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  42.45 
 
 		 685 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  42.45 
 
 		 685 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  43.39 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  42.31 
 
 		 685 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  42.31 
 
 		 685 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  42.82 
 
 		 686 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  40.66 
 
 		 700 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  42.17 
 
 		 685 aa  532  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  43.02 
 
 		 690 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  40.95 
 
 		 695 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  41.74 
 
 		 658 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  40.08 
 
 		 695 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  41.77 
 
 		 686 aa  522  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  41.59 
 
 		 658 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  42.74 
 
 		 687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  41.38 
 
 		 684 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  42.01 
 
 		 681 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  41.87 
 
 		 681 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  40.76 
 
 		 694 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  42.01 
 
 		 681 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  42.01 
 
 		 681 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  42.01 
 
 		 681 aa  502  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  43.46 
 
 		 628 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  40.96 
 
 		 702 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  41.45 
 
 		 690 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  41.45 
 
 		 690 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  41.45 
 
 		 690 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  41.45 
 
 		 690 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  41.45 
 
 		 690 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  41.45 
 
 		 690 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  39.08 
 
 		 705 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  39.08 
 
 		 705 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.62 
 
 		 695 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  39.08 
 
 		 705 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.7 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  39.61 
 
 		 738 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  39.27 
 
 		 739 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  39.27 
 
 		 739 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.9 
 
 		 692 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  37.02 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.32 
 
 		 692 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.12 
 
 		 689 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.45 
 
 		 694 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.76 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.48 
 
 		 692 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  39.86 
 
 		 729 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.7 
 
 		 696 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  39.32 
 
 		 734 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.38 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.18 
 
 		 694 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.23 
 
 		 694 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.93 
 
 		 711 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.52 
 
 		 686 aa  428  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.78 
 
 		 697 aa  425  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  39.63 
 
 		 749 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.91 
 
 		 680 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.85 
 
 		 676 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.64 
 
 		 682 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.32 
 
 		 696 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.42 
 
 		 705 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.46 
 
 		 700 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.72 
 
 		 703 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 		 700 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.99 
 
 		 699 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.88 
 
 		 708 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.05 
 
 		 702 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.14 
 
 		 679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.39 
 
 		 695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.71 
 
 		 681 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.45 
 
 		 703 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 		 703 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.66 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.47 
 
 		 708 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.72 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.88 
 
 		 711 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.4 
 
 		 710 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.54 
 
 		 673 aa  399  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.68 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.95 
 
 		 690 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.46 
 
 		 709 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>