More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0156 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  75.43 
 
 
699 aa  1044    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.71 
 
 
695 aa  701    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.09 
 
 
696 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  82.93 
 
 
703 aa  1129    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.17 
 
 
692 aa  718    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  71.88 
 
 
695 aa  992    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.84 
 
 
694 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.22 
 
 
694 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  80 
 
 
703 aa  1107    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.3 
 
 
694 aa  724    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.87 
 
 
696 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.22 
 
 
708 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
695 aa  703    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.02 
 
 
692 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
703 aa  1408    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
686 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.84 
 
 
686 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.68 
 
 
689 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.74 
 
 
676 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.88 
 
 
711 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.31 
 
 
674 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.67 
 
 
690 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.57 
 
 
692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.29 
 
 
706 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.46 
 
 
673 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.27 
 
 
693 aa  595  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.96 
 
 
703 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.28 
 
 
682 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.58 
 
 
698 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.1 
 
 
692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.62 
 
 
700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.9 
 
 
702 aa  585  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.82 
 
 
679 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.19 
 
 
697 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.17 
 
 
688 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.77 
 
 
693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.73 
 
 
698 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.93 
 
 
678 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.12 
 
 
690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.05 
 
 
705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.08 
 
 
695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1638  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.48 
 
 
692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.885636  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.78 
 
 
678 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.24 
 
 
700 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.78 
 
 
678 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.2 
 
 
697 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.43 
 
 
677 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.59 
 
 
697 aa  567  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.88 
 
 
700 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.47 
 
 
711 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.78 
 
 
700 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.86 
 
 
699 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
700 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.86 
 
 
710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.82 
 
 
699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.76 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.62 
 
 
690 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.35 
 
 
690 aa  565  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.7 
 
 
710 aa  565  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.1 
 
 
699 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
692 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1651  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.04 
 
 
693 aa  560  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0916623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.87 
 
 
697 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.3 
 
 
700 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.82 
 
 
695 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.3 
 
 
700 aa  562  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.92 
 
 
680 aa  558  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  46.04 
 
 
696 aa  558  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.25 
 
 
692 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.18 
 
 
697 aa  558  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.9 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.9 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.9 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.5 
 
 
700 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.87 
 
 
696 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.04 
 
 
710 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.61 
 
 
709 aa  555  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.74 
 
 
699 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.02 
 
 
730 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.86 
 
 
684 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.58 
 
 
720 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.72 
 
 
709 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.71 
 
 
699 aa  555  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.16 
 
 
744 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.86 
 
 
684 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.18 
 
 
708 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.18 
 
 
708 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  45.89 
 
 
694 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.28 
 
 
709 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.52 
 
 
700 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  45 
 
 
745 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.07 
 
 
699 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.23 
 
 
748 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>