More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3906 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.4 
 
 
715 aa  912    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.53 
 
 
713 aa  889    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.54 
 
 
708 aa  937    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  85.25 
 
 
709 aa  1166    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.01 
 
 
720 aa  843    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.29 
 
 
711 aa  964    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
709 aa  1408    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.83 
 
 
704 aa  929    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.21 
 
 
731 aa  689    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  90.1 
 
 
711 aa  1228    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  86.4 
 
 
682 aa  1119    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  96.48 
 
 
744 aa  1304    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  87.29 
 
 
745 aa  1164    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.03 
 
 
710 aa  849    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.03 
 
 
703 aa  790    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.1 
 
 
714 aa  916    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.44 
 
 
691 aa  701    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.71 
 
 
713 aa  890    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  90.85 
 
 
710 aa  1236    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.41 
 
 
695 aa  609  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.82 
 
 
696 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.92 
 
 
723 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 
696 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.57 
 
 
695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.66 
 
 
696 aa  571  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.64 
 
 
695 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.73 
 
 
708 aa  567  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.48 
 
 
696 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.34 
 
 
692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.04 
 
 
692 aa  561  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.72 
 
 
703 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.22 
 
 
694 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.98 
 
 
695 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.91 
 
 
694 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.93 
 
 
696 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.43 
 
 
694 aa  558  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.3 
 
 
696 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.83 
 
 
693 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.62 
 
 
684 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.05 
 
 
695 aa  555  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.32 
 
 
693 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.61 
 
 
693 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.61 
 
 
693 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
700 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.88 
 
 
696 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.14 
 
 
700 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.94 
 
 
695 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
693 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.26 
 
 
703 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.98 
 
 
686 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.73 
 
 
698 aa  542  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.93 
 
 
694 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.08 
 
 
695 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.29 
 
 
698 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.23 
 
 
692 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 
690 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.63 
 
 
693 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.02 
 
 
697 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.7 
 
 
695 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.62 
 
 
703 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.97 
 
 
700 aa  535  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.19 
 
 
690 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.2 
 
 
695 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.4 
 
 
700 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.49 
 
 
700 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.64 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  43.24 
 
 
694 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.64 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.64 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.94 
 
 
695 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.17 
 
 
697 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.98 
 
 
699 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.42 
 
 
700 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.43 
 
 
699 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.7 
 
 
730 aa  521  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.19 
 
 
699 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.19 
 
 
699 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.21 
 
 
696 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.81 
 
 
697 aa  520  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.28 
 
 
689 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.1 
 
 
692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.74 
 
 
692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.04 
 
 
697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0724  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.53 
 
 
723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0457553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.24 
 
 
706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.65 
 
 
703 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.34 
 
 
708 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.34 
 
 
708 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.76 
 
 
702 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.08 
 
 
690 aa  515  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.56 
 
 
694 aa  515  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.41 
 
 
694 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>