More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3049 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2062  type III secretion system protein BsaQ  55.15 
 
 
690 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.287404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  99.85 
 
 
685 aa  1368    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  99.85 
 
 
685 aa  1367    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  64.24 
 
 
686 aa  890    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1542  type III secretion system protein BsaQ  55.15 
 
 
690 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.516262  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0742  type III secretion system protein BsaQ  55.15 
 
 
690 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0433938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0584  type III secretion system protein BsaQ  55.15 
 
 
690 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000770866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2173  HrcV family type III secretion protein  55.15 
 
 
690 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.324118  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  54.47 
 
 
702 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2085  HrcV family type III secretion protein  55.15 
 
 
690 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  100 
 
 
685 aa  1369    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  64.48 
 
 
686 aa  865    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  100 
 
 
685 aa  1369    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  99.85 
 
 
685 aa  1367    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  42.31 
 
 
705 aa  548  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  41.93 
 
 
704 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  41.78 
 
 
705 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  39.32 
 
 
682 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  39.32 
 
 
682 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  41.91 
 
 
706 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  40.51 
 
 
696 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  41.5 
 
 
685 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  41.21 
 
 
685 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  39.76 
 
 
697 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  38.59 
 
 
675 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  38.68 
 
 
690 aa  465  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  38.38 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  38.24 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  38.38 
 
 
690 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  38.38 
 
 
690 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  38.38 
 
 
690 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  37.68 
 
 
708 aa  457  1e-127  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  38.94 
 
 
700 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  38.18 
 
 
1327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.4 
 
 
681 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.4 
 
 
681 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  38.65 
 
 
695 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.4 
 
 
681 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.4 
 
 
681 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.4 
 
 
681 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  37.99 
 
 
695 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  37.46 
 
 
700 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  38.23 
 
 
684 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  38.04 
 
 
658 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  37.45 
 
 
694 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  37.56 
 
 
658 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  36.42 
 
 
687 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  36.52 
 
 
690 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.54 
 
 
686 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 
697 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.3 
 
 
699 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.01 
 
 
710 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.02 
 
 
697 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  35.68 
 
 
705 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.97 
 
 
695 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  35.68 
 
 
705 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.58 
 
 
695 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.37 
 
 
693 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.39 
 
 
692 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  35.83 
 
 
705 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.37 
 
 
692 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.42 
 
 
693 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 
698 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 
690 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.88 
 
 
674 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.24 
 
 
679 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.64 
 
 
695 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.45 
 
 
690 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.53 
 
 
708 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.68 
 
 
696 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.51 
 
 
698 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.47 
 
 
694 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.24 
 
 
700 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  36.27 
 
 
691 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.23 
 
 
699 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  33 
 
 
699 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 
694 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.41 
 
 
697 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.37 
 
 
706 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.99 
 
 
703 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.02 
 
 
692 aa  369  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.53 
 
 
699 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.41 
 
 
689 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.83 
 
 
692 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.53 
 
 
699 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.53 
 
 
699 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.7 
 
 
694 aa  365  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.7 
 
 
694 aa  364  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.4 
 
 
692 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  33.71 
 
 
738 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  33.66 
 
 
739 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  33.66 
 
 
739 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.9 
 
 
673 aa  363  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.71 
 
 
678 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.84 
 
 
699 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.84 
 
 
699 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.84 
 
 
699 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.09 
 
 
700 aa  362  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.15 
 
 
697 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.71 
 
 
678 aa  362  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>