More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5931 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  61.65 
 
 		 690 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  71.89 
 
 		 690 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  72.04 
 
 		 690 aa  971    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  72.04 
 
 		 690 aa  971    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  66.43 
 
 		 705 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  71.89 
 
 		 1327 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  72.62 
 
 		 690 aa  974    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  66.43 
 
 		 705 aa  868    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  71.89 
 
 		 690 aa  971    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  71.89 
 
 		 690 aa  971    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  66.57 
 
 		 705 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  100 
 
 		 684 aa  1368    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  65.84 
 
 		 658 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  61.19 
 
 		 628 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  58.57 
 
 		 687 aa  752    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  65.84 
 
 		 658 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  44.11 
 
 		 704 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  43.13 
 
 		 705 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  41.38 
 
 		 705 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  41.62 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  42.11 
 
 		 696 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  44.93 
 
 		 706 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  45.01 
 
 		 739 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  45.01 
 
 		 739 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  45.07 
 
 		 738 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  45.81 
 
 		 729 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  41.04 
 
 		 675 aa  479  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  39.11 
 
 		 708 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  44.69 
 
 		 734 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  39.21 
 
 		 682 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  39.21 
 
 		 682 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  39 
 
 		 685 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4230  type III secretion FHIPEP protein  44.83 
 
 		 749 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.708794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  39.5 
 
 		 685 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  40.03 
 
 		 695 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  37.85 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  40.5 
 
 		 695 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3101  invasion protein InvA  38.21 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.758436  hitchhiker  0.000000202364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  38.12 
 
 		 700 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3049  invasion protein InvA  38.21 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.459532  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3018  invasion protein InvA  38.21 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3206  invasion protein InvA  38.35 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3086  invasion protein InvA  38.21 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  39.5 
 
 		 694 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1525  secretion system apparatus protein SsaV  38.5 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1510  secretion system apparatus protein SsaV  38.5 
 
 		 681 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113276  normal  0.87404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1759  secretion system apparatus protein SsaV  38.25 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0357645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  35.61 
 
 		 686 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1929  secretion system apparatus protein SsaV  38.5 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.401971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1547  secretion system apparatus protein SsaV  38.5 
 
 		 681 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  35.96 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.93 
 
 		 695 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.72 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.7 
 
 		 694 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.51 
 
 		 690 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.7 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 692 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.13 
 
 		 699 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.14 
 
 		 700 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.15 
 
 		 695 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.25 
 
 		 702 aa  366  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.16 
 
 		 693 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.38 
 
 		 710 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.09 
 
 		 697 aa  363  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.15 
 
 		 699 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.7 
 
 		 703 aa  362  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.91 
 
 		 676 aa  359  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.62 
 
 		 699 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 699 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 699 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  34.52 
 
 		 691 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 694 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.47 
 
 		 705 aa  356  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.91 
 
 		 693 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.1 
 
 		 700 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.52 
 
 		 699 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.96 
 
 		 698 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.74 
 
 		 697 aa  354  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.85 
 
 		 696 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.66 
 
 		 699 aa  353  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.63 
 
 		 690 aa  353  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.68 
 
 		 699 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 699 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.49 
 
 		 689 aa  350  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.63 
 
 		 687 aa  349  8e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.84 
 
 		 694 aa  349  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.16 
 
 		 708 aa  349  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3119  putative membrane low calcium response protein, LcrD, Type III secretion  38.71 
 
 		 692 aa  349  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.376971  hitchhiker  0.0044205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.19 
 
 		 699 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5208  type III secretion FHIPEP protein  40.79 
 
 		 691 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.27 
 
 		 706 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.49 
 
 		 690 aa  347  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.43 
 
 		 696 aa  347  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.91 
 
 		 702 aa  346  8.999999999999999e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.35 
 
 		 700 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 		 699 aa  346  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>