More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2179 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.6 
 
 
713 aa  865    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
711 aa  1420    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.93 
 
 
708 aa  883    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.32 
 
 
704 aa  883    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.93 
 
 
709 aa  920    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.31 
 
 
710 aa  919    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.71 
 
 
682 aa  910    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.22 
 
 
720 aa  909    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.38 
 
 
709 aa  919    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.1 
 
 
711 aa  943    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.38 
 
 
744 aa  919    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.39 
 
 
745 aa  924    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.68 
 
 
695 aa  641    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.79 
 
 
691 aa  712    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.1 
 
 
703 aa  861    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.89 
 
 
710 aa  894    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.85 
 
 
715 aa  867    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.44 
 
 
731 aa  680    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.45 
 
 
713 aa  861    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.99 
 
 
714 aa  901    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.6 
 
 
708 aa  618  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.14 
 
 
696 aa  608  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.99 
 
 
696 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.35 
 
 
695 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.15 
 
 
696 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.73 
 
 
696 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.33 
 
 
692 aa  595  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.23 
 
 
694 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.33 
 
 
692 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.83 
 
 
695 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.61 
 
 
694 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  46 
 
 
703 aa  592  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.95 
 
 
723 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
695 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.95 
 
 
695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 
694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.08 
 
 
694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.28 
 
 
693 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.9 
 
 
696 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.76 
 
 
703 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.84 
 
 
695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.42 
 
 
693 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.26 
 
 
696 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.56 
 
 
693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.56 
 
 
693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.66 
 
 
693 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.54 
 
 
695 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.47 
 
 
696 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.07 
 
 
699 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.43 
 
 
703 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  45.48 
 
 
694 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.82 
 
 
690 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.77 
 
 
699 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.21 
 
 
690 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.94 
 
 
697 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.64 
 
 
684 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.22 
 
 
710 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.19 
 
 
695 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.92 
 
 
686 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 
698 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.75 
 
 
697 aa  555  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.2 
 
 
700 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.06 
 
 
697 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.98 
 
 
689 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.39 
 
 
695 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.99 
 
 
708 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.99 
 
 
708 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  44.44 
 
 
696 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.6 
 
 
693 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
692 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 
698 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.71 
 
 
695 aa  545  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.9 
 
 
699 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.85 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.56 
 
 
699 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.32 
 
 
706 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 
692 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.35 
 
 
699 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.92 
 
 
692 aa  538  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 
705 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.31 
 
 
700 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.97 
 
 
700 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.04 
 
 
686 aa  535  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.19 
 
 
703 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.55 
 
 
702 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.34 
 
 
699 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.25 
 
 
676 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.37 
 
 
690 aa  529  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.71 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.05 
 
 
700 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.25 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.34 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.05 
 
 
699 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>