More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3367 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  86.04 
 
 
710 aa  1175    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.44 
 
 
708 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.35 
 
 
714 aa  942    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  92.67 
 
 
709 aa  1238    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.57 
 
 
720 aa  844    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.67 
 
 
711 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  87.29 
 
 
709 aa  1178    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.75 
 
 
731 aa  694    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.63 
 
 
713 aa  912    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  88.62 
 
 
711 aa  1207    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  88.14 
 
 
682 aa  1126    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  85.16 
 
 
744 aa  1206    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
745 aa  1483    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.86 
 
 
703 aa  795    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  70.2 
 
 
704 aa  946    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.74 
 
 
710 aa  855    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.96 
 
 
691 aa  708    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  70.22 
 
 
715 aa  936    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.63 
 
 
713 aa  911    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.92 
 
 
695 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.18 
 
 
696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.49 
 
 
696 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  47 
 
 
723 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 
695 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.41 
 
 
696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.33 
 
 
695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.35 
 
 
708 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.54 
 
 
692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.91 
 
 
694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.63 
 
 
694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.83 
 
 
696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.84 
 
 
692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.61 
 
 
703 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.27 
 
 
693 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.74 
 
 
694 aa  561  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.07 
 
 
695 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.4 
 
 
693 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.81 
 
 
693 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.92 
 
 
695 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.4 
 
 
693 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.56 
 
 
696 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.47 
 
 
686 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.4 
 
 
696 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
684 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.69 
 
 
692 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.05 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.29 
 
 
703 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
700 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.17 
 
 
696 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.05 
 
 
698 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.49 
 
 
694 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.2 
 
 
695 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.56 
 
 
695 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.4 
 
 
693 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
693 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.87 
 
 
700 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.64 
 
 
690 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.96 
 
 
690 aa  545  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.8 
 
 
700 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.1 
 
 
700 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.11 
 
 
706 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.53 
 
 
695 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.24 
 
 
697 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.06 
 
 
698 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.41 
 
 
703 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.56 
 
 
692 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.11 
 
 
709 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  44.1 
 
 
694 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.34 
 
 
697 aa  538  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  42.16 
 
 
696 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.97 
 
 
702 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.6 
 
 
700 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.67 
 
 
699 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.78 
 
 
695 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.6 
 
 
700 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.83 
 
 
695 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.11 
 
 
708 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.6 
 
 
700 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.11 
 
 
708 aa  535  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.98 
 
 
703 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.19 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.03 
 
 
705 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.12 
 
 
689 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.02 
 
 
699 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.99 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.99 
 
 
699 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 
694 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.15 
 
 
699 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.99 
 
 
700 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 
694 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.97 
 
 
710 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.67 
 
 
748 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.81 
 
 
697 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.69 
 
 
730 aa  523  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>