More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3666 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.8 
 
 		 708 aa  930    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.23 
 
 		 711 aa  962    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  91.42 
 
 		 710 aa  1235    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.34 
 
 		 715 aa  909    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  84.87 
 
 		 709 aa  1162    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.24 
 
 		 713 aa  886    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.6 
 
 		 720 aa  841    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  96.91 
 
 		 709 aa  1308    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.52 
 
 		 713 aa  885    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.63 
 
 		 704 aa  919    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  90.27 
 
 		 711 aa  1230    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  86.15 
 
 		 682 aa  1118    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 		 744 aa  1478    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  85.03 
 
 		 745 aa  1194    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.7 
 
 		 710 aa  847    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.71 
 
 		 703 aa  792    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.95 
 
 		 714 aa  915    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.43 
 
 		 691 aa  707    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.05 
 
 		 731 aa  688    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.43 
 
 		 695 aa  612  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.83 
 
 		 696 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.21 
 
 		 723 aa  582  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.07 
 
 		 696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.3 
 
 		 695 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.94 
 
 		 696 aa  572  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.78 
 
 		 696 aa  568  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.47 
 
 		 708 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.17 
 
 		 695 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.98 
 
 		 695 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 		 692 aa  562  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.59 
 
 		 703 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.5 
 
 		 692 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.19 
 
 		 693 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.94 
 
 		 694 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.7 
 
 		 694 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 		 696 aa  558  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.19 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 		 693 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.85 
 
 		 693 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.92 
 
 		 684 aa  555  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.04 
 
 		 696 aa  555  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 		 693 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.66 
 
 		 696 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.61 
 
 		 695 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 		 695 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.48 
 
 		 693 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 		 700 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 		 694 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 		 700 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.38 
 
 		 695 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.22 
 
 		 698 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 		 695 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.9 
 
 		 703 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.6 
 
 		 703 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.65 
 
 		 693 aa  538  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.07 
 
 		 686 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.7 
 
 		 692 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 		 690 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.5 
 
 		 695 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.29 
 
 		 700 aa  535  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.58 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.93 
 
 		 698 aa  532  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.74 
 
 		 695 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.24 
 
 		 697 aa  528  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.17 
 
 		 697 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.21 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.59 
 
 		 699 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  42.84 
 
 		 694 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.75 
 
 		 730 aa  525  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.21 
 
 		 700 aa  525  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.01 
 
 		 699 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.6 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.53 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2839  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.66 
 
 		 700 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.753439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.66 
 
 		 700 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0250  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.66 
 
 		 700 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.96 
 
 		 700 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.06 
 
 		 699 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.02 
 
 		 700 aa  522  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0195  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.75 
 
 		 700 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.11 
 
 		 706 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.75 
 
 		 700 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.44 
 
 		 694 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.11 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3371  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.21 
 
 		 699 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0724  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.72 
 
 		 723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0457553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.62 
 
 		 697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.88 
 
 		 692 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.85 
 
 		 702 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.11 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.77 
 
 		 705 aa  515  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.13 
 
 		 686 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.04 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.29 
 
 		 694 aa  515  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>