More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2953 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3258  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.46 
 
 		 698 aa  837    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2613  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.47 
 
 		 689 aa  911    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1320  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.61 
 
 		 688 aa  831    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.1 
 
 		 693 aa  904    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 		 696 aa  1390    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2979  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.61 
 
 		 688 aa  831    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.948714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2628  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.44 
 
 		 694 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  42 
 
 		 711 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.57 
 
 		 710 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.63 
 
 		 709 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.48 
 
 		 711 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.51 
 
 		 744 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.76 
 
 		 710 aa  511  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.29 
 
 		 714 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.92 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.19 
 
 		 720 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.14 
 
 		 703 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.9 
 
 		 708 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.23 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.85 
 
 		 704 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.91 
 
 		 696 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 		 696 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.8 
 
 		 713 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.8 
 
 		 713 aa  485  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.09 
 
 		 745 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.15 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.97 
 
 		 693 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.03 
 
 		 715 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.93 
 
 		 696 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.34 
 
 		 693 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.05 
 
 		 693 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.27 
 
 		 695 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.62 
 
 		 696 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.47 
 
 		 695 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.64 
 
 		 731 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.22 
 
 		 696 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.95 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.55 
 
 		 695 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.34 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.28 
 
 		 723 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.62 
 
 		 695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.2 
 
 		 694 aa  436  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.6 
 
 		 692 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.27 
 
 		 684 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.08 
 
 		 695 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.57 
 
 		 694 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.85 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.21 
 
 		 695 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.09 
 
 		 702 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.63 
 
 		 686 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.35 
 
 		 696 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.8 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.41 
 
 		 700 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.65 
 
 		 699 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.33 
 
 		 706 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.12 
 
 		 699 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.04 
 
 		 694 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.95 
 
 		 694 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.31 
 
 		 699 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.9 
 
 		 692 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35 
 
 		 710 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.04 
 
 		 694 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.95 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.75 
 
 		 705 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.13 
 
 		 699 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 703 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.36 
 
 		 690 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.66 
 
 		 686 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.35 
 
 		 693 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.01 
 
 		 693 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.66 
 
 		 695 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.07 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.63 
 
 		 698 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.93 
 
 		 686 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.09 
 
 		 708 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.37 
 
 		 693 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.39 
 
 		 696 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.62 
 
 		 697 aa  402  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 699 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.93 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.9 
 
 		 695 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.19 
 
 		 697 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.26 
 
 		 708 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  41.34 
 
 		 694 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 		 697 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.25 
 
 		 700 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 699 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.07 
 
 		 699 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.08 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.88 
 
 		 709 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.99 
 
 		 690 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.25 
 
 		 700 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.4 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 699 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.36 
 
 		 676 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>