More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3258 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2979  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.91 
 
 		 688 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.948714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2613  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.54 
 
 		 689 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1320  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.91 
 
 		 688 aa  778    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.14 
 
 		 693 aa  817    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.46 
 
 		 696 aa  839    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3258  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 		 698 aa  1387    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2628  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.38 
 
 		 694 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.52 
 
 		 711 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.26 
 
 		 696 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.94 
 
 		 710 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.32 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.16 
 
 		 744 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.5 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.13 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.6 
 
 		 711 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.32 
 
 		 723 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.14 
 
 		 710 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.29 
 
 		 703 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.41 
 
 		 708 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.25 
 
 		 714 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.99 
 
 		 696 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.67 
 
 		 693 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.16 
 
 		 696 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.62 
 
 		 695 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.04 
 
 		 695 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.41 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.5 
 
 		 709 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.38 
 
 		 682 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.62 
 
 		 745 aa  459  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.05 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.79 
 
 		 693 aa  459  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.17 
 
 		 695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.53 
 
 		 731 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.19 
 
 		 693 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.29 
 
 		 684 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.8 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.64 
 
 		 713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.57 
 
 		 713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.87 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.11 
 
 		 694 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.45 
 
 		 695 aa  439  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.72 
 
 		 715 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.09 
 
 		 697 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.86 
 
 		 695 aa  429  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.16 
 
 		 706 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.27 
 
 		 694 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.93 
 
 		 696 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.39 
 
 		 697 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.75 
 
 		 694 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.34 
 
 		 697 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.69 
 
 		 699 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.31 
 
 		 690 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 692 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.57 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.65 
 
 		 692 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.89 
 
 		 692 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.95 
 
 		 703 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.4 
 
 		 698 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.46 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.19 
 
 		 680 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.17 
 
 		 686 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.42 
 
 		 700 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.64 
 
 		 710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.94 
 
 		 708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.43 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 700 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.49 
 
 		 693 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.85 
 
 		 700 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.01 
 
 		 708 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.61 
 
 		 681 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.59 
 
 		 703 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 		 700 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  37.38 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.9 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.02 
 
 		 695 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.93 
 
 		 680 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.55 
 
 		 699 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.16 
 
 		 693 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.57 
 
 		 694 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.54 
 
 		 693 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.3 
 
 		 698 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.65 
 
 		 690 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.69 
 
 		 699 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.93 
 
 		 696 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0182  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.67 
 
 		 700 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.06 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.57 
 
 		 694 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.07 
 
 		 709 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.92 
 
 		 748 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0268  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 		 700 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0416492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.86 
 
 		 724 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>