More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0283 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.23 
 
 
693 aa  899    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  70.44 
 
 
723 aa  965    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.41 
 
 
684 aa  944    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
695 aa  1389    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  84.05 
 
 
696 aa  1175    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  84.17 
 
 
695 aa  1183    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.38 
 
 
696 aa  911    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.94 
 
 
693 aa  908    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  84.6 
 
 
695 aa  1160    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.79 
 
 
696 aa  977    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.47 
 
 
695 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  70.44 
 
 
696 aa  983    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.27 
 
 
693 aa  904    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.1 
 
 
695 aa  996    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.79 
 
 
696 aa  962    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.94 
 
 
693 aa  909    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  65.44 
 
 
694 aa  907    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.39 
 
 
711 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.05 
 
 
711 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.52 
 
 
710 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.59 
 
 
709 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.78 
 
 
710 aa  547  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
744 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.91 
 
 
714 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.79 
 
 
708 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
709 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 
720 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.9 
 
 
703 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.22 
 
 
745 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.07 
 
 
731 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.37 
 
 
682 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.35 
 
 
704 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
691 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.78 
 
 
715 aa  522  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.82 
 
 
713 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.67 
 
 
713 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.5 
 
 
695 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.47 
 
 
696 aa  475  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.05 
 
 
693 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.02 
 
 
692 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.22 
 
 
698 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.7 
 
 
699 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3258  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.87 
 
 
698 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.94 
 
 
695 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.78 
 
 
693 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.37 
 
 
694 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.62 
 
 
698 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.54 
 
 
693 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.32 
 
 
694 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2613  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.5 
 
 
689 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.7 
 
 
695 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.17 
 
 
694 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.71 
 
 
692 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.06 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.57 
 
 
699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.57 
 
 
692 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.76 
 
 
693 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.61 
 
 
695 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  39.07 
 
 
694 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 
690 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.65 
 
 
710 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.54 
 
 
696 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.23 
 
 
689 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.83 
 
 
697 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.31 
 
 
700 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.76 
 
 
709 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.79 
 
 
699 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.79 
 
 
699 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.06 
 
 
700 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.39 
 
 
708 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.37 
 
 
699 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.7 
 
 
696 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.68 
 
 
695 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.26 
 
 
693 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.91 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.99 
 
 
699 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1619  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.53 
 
 
700 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.41 
 
 
706 aa  435  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.5 
 
 
699 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.31 
 
 
700 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.27 
 
 
703 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.17 
 
 
700 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.31 
 
 
700 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 
700 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.51 
 
 
699 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.61 
 
 
748 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.07 
 
 
694 aa  432  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.3 
 
 
694 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0724  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.56 
 
 
723 aa  429  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0457553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.46 
 
 
709 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.36 
 
 
699 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.07 
 
 
699 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.36 
 
 
699 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.15 
 
 
699 aa  429  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>