More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0539 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.32 
 
 
682 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.22 
 
 
711 aa  924    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.56 
 
 
709 aa  812    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.65 
 
 
710 aa  830    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.95 
 
 
731 aa  685    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.91 
 
 
713 aa  732    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
720 aa  1451    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.39 
 
 
709 aa  817    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  61.61 
 
 
711 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.46 
 
 
744 aa  814    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.68 
 
 
745 aa  809    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.06 
 
 
713 aa  734    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.75 
 
 
691 aa  750    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.14 
 
 
704 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.74 
 
 
708 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.77 
 
 
710 aa  816    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.22 
 
 
714 aa  756    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.06 
 
 
715 aa  754    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  59.57 
 
 
703 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.53 
 
 
708 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.97 
 
 
695 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.14 
 
 
694 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.65 
 
 
695 aa  586  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.36 
 
 
696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.7 
 
 
692 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.46 
 
 
692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.89 
 
 
694 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 
695 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.12 
 
 
696 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.64 
 
 
696 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.64 
 
 
694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.05 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.99 
 
 
693 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.21 
 
 
696 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.57 
 
 
696 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.8 
 
 
696 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.87 
 
 
695 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.88 
 
 
723 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.5 
 
 
690 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.27 
 
 
693 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.27 
 
 
693 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.35 
 
 
696 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.12 
 
 
693 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.7 
 
 
686 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.22 
 
 
695 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.64 
 
 
692 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.64 
 
 
703 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.67 
 
 
694 aa  545  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.79 
 
 
699 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.73 
 
 
703 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 
695 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 
689 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.59 
 
 
693 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.28 
 
 
698 aa  535  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 
693 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.37 
 
 
690 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.5 
 
 
695 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.84 
 
 
695 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.96 
 
 
697 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  43.25 
 
 
694 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.13 
 
 
690 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
697 aa  528  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.45 
 
 
706 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.82 
 
 
698 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  42.24 
 
 
696 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.52 
 
 
703 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.33 
 
 
684 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.36 
 
 
708 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.47 
 
 
703 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.36 
 
 
708 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.37 
 
 
730 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.2 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.15 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.89 
 
 
702 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.12 
 
 
690 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.05 
 
 
695 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.93 
 
 
693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.18 
 
 
692 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.27 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.71 
 
 
697 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.54 
 
 
697 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.82 
 
 
699 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.82 
 
 
699 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 
710 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.06 
 
 
694 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.06 
 
 
694 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.12 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.96 
 
 
692 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.52 
 
 
692 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 
695 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.57 
 
 
709 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.41 
 
 
699 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.29 
 
 
699 aa  512  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.02 
 
 
705 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>