More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2628 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2628  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
694 aa  1379    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.44 
 
 
696 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2613  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.22 
 
 
689 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.5 
 
 
693 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1320  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.81 
 
 
688 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3258  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.38 
 
 
698 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2979  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.81 
 
 
688 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.948714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.9 
 
 
711 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.77 
 
 
696 aa  425  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.97 
 
 
710 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.29 
 
 
693 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.95 
 
 
691 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.18 
 
 
696 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.83 
 
 
696 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.48 
 
 
720 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.42 
 
 
703 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.96 
 
 
696 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.7 
 
 
693 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.67 
 
 
695 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.43 
 
 
702 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.23 
 
 
693 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.21 
 
 
723 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.29 
 
 
709 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.34 
 
 
711 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.27 
 
 
744 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  36 
 
 
695 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.57 
 
 
709 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.81 
 
 
693 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.84 
 
 
682 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.07 
 
 
699 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.07 
 
 
699 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.12 
 
 
714 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.43 
 
 
710 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.16 
 
 
731 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.6 
 
 
699 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.39 
 
 
699 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.26 
 
 
699 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.11 
 
 
699 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.11 
 
 
699 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.77 
 
 
693 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 
745 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.11 
 
 
699 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.91 
 
 
699 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.22 
 
 
693 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  38.55 
 
 
694 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.54 
 
 
695 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.34 
 
 
696 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.15 
 
 
700 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.59 
 
 
692 aa  392  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.48 
 
 
699 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.51 
 
 
693 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.75 
 
 
715 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.78 
 
 
694 aa  389  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 
699 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.78 
 
 
694 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.48 
 
 
710 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.18 
 
 
699 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.26 
 
 
690 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.01 
 
 
695 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.76 
 
 
698 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.96 
 
 
706 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.91 
 
 
699 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.16 
 
 
697 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.03 
 
 
705 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.16 
 
 
713 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.54 
 
 
699 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.16 
 
 
713 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.47 
 
 
684 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.28 
 
 
697 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.93 
 
 
708 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.45 
 
 
699 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.78 
 
 
692 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0962  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.8 
 
 
724 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.77 
 
 
717 aa  379  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0890  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.8 
 
 
711 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.95 
 
 
704 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.12 
 
 
700 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.93 
 
 
695 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 
699 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.63 
 
 
708 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1027  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.52 
 
 
711 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00636913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.81 
 
 
695 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.73 
 
 
696 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.74 
 
 
699 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.57 
 
 
692 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.63 
 
 
693 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.96 
 
 
695 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.63 
 
 
697 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.32 
 
 
680 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.92 
 
 
694 aa  375  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.19 
 
 
697 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.28 
 
 
692 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.95 
 
 
694 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.07 
 
 
697 aa  372  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.7 
 
 
698 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.52 
 
 
703 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.24 
 
 
692 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.27 
 
 
690 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.42 
 
 
699 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.52 
 
 
681 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>