More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2695 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.24 
 
 
679 aa  715    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.19 
 
 
686 aa  708    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.53 
 
 
688 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  52.74 
 
 
673 aa  680    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.95 
 
 
674 aa  769    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 
681 aa  662    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.37 
 
 
678 aa  692    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.76 
 
 
682 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.89 
 
 
676 aa  791    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
686 aa  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2695  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
677 aa  1358    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.95 
 
 
690 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.55 
 
 
695 aa  630  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.95 
 
 
692 aa  618  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.27 
 
 
689 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.79 
 
 
678 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.26 
 
 
694 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.79 
 
 
678 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.88 
 
 
697 aa  598  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.09 
 
 
696 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.82 
 
 
692 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 
694 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.68 
 
 
692 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.01 
 
 
694 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.19 
 
 
688 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.3 
 
 
690 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
695 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.48 
 
 
703 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
695 aa  565  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.22 
 
 
692 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.01 
 
 
703 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2014  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.3 
 
 
703 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.02 
 
 
708 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.09 
 
 
696 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.01 
 
 
696 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.49 
 
 
680 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1438  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.12 
 
 
680 aa  548  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.937514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.61 
 
 
687 aa  548  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1138  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.89 
 
 
717 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.501874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.57 
 
 
706 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.47 
 
 
703 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0331  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
699 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.7 
 
 
711 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.56 
 
 
693 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.3 
 
 
697 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.09 
 
 
699 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.18 
 
 
702 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.38 
 
 
699 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.74 
 
 
700 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.74 
 
 
697 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0405  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.03 
 
 
712 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245167  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.24 
 
 
690 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.66 
 
 
681 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.36 
 
 
705 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.83 
 
 
708 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.83 
 
 
708 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4141  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.66 
 
 
697 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.303073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.5 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1398  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.59 
 
 
710 aa  512  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
699 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.88 
 
 
699 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
699 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.97 
 
 
710 aa  515  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.12 
 
 
710 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.82 
 
 
699 aa  512  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  40.15 
 
 
696 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.64 
 
 
697 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.68 
 
 
702 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
699 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.01 
 
 
684 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.57 
 
 
700 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
699 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.53 
 
 
708 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
699 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.24 
 
 
700 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.39 
 
 
694 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.59 
 
 
699 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.15 
 
 
700 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.26 
 
 
699 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.26 
 
 
699 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.32 
 
 
699 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.74 
 
 
699 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.01 
 
 
699 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.24 
 
 
694 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.95 
 
 
700 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.51 
 
 
700 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.33 
 
 
698 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1365  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.31 
 
 
730 aa  505  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0908746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.32 
 
 
690 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.36 
 
 
695 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.75 
 
 
695 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  39.49 
 
 
694 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  40 
 
 
700 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>